Removing SmartPlugDetector.
[pingpong.git] / Code / Projects / SmartPlugDetector / src / main / java / edu / uci / iotproject / util / PcapPacketUtils.java
diff --git a/Code/Projects/SmartPlugDetector/src/main/java/edu/uci/iotproject/util/PcapPacketUtils.java b/Code/Projects/SmartPlugDetector/src/main/java/edu/uci/iotproject/util/PcapPacketUtils.java
deleted file mode 100644 (file)
index 067af93..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,484 +0,0 @@
-package edu.uci.iotproject.util;
-
-import edu.uci.iotproject.trafficreassembly.layer3.Conversation;
-import edu.uci.iotproject.analysis.PcapPacketPair;
-import edu.uci.iotproject.analysis.TcpConversationUtils;
-import edu.uci.iotproject.analysis.TriggerTrafficExtractor;
-import org.apache.commons.math3.stat.clustering.Cluster;
-import org.pcap4j.core.PcapPacket;
-import org.pcap4j.packet.EthernetPacket;
-import org.pcap4j.packet.IpV4Packet;
-import org.pcap4j.packet.TcpPacket;
-import org.pcap4j.util.MacAddress;
-
-import java.util.*;
-
-/**
- * Utility methods for inspecting {@link PcapPacket} properties.
- *
- * @author Janus Varmarken {@literal <jvarmark@uci.edu>}
- * @author Rahmadi Trimananda {@literal <rtrimana@uci.edu>}
- */
-public final class PcapPacketUtils {
-
-    /**
-     * This is the threshold value for a signature's number of members
-     * If after a merging the number of members of a signature falls below this threshold, then we can boldly
-     * get rid of that signature.
-     */
-    private static final int SIGNATURE_MERGE_THRESHOLD = 5;
-
-    /**
-     * This is an overlap counter (we consider overlaps between signatures if it happens more than once)
-     */
-    private static int mOverlapCounter = 0;
-
-
-    /**
-     * Gets the source address of the Ethernet part of {@code packet}.
-     * @param packet The packet for which the Ethernet source address is to be extracted.
-     * @return The source address of the Ethernet part of {@code packet}.
-     */
-    public static MacAddress getEthSrcAddr(PcapPacket packet) {
-        return getEthernetPacketOrThrow(packet).getHeader().getSrcAddr();
-    }
-
-    /**
-     * Gets the destination address of the Ethernet part of {@code packet}.
-     * @param packet The packet for which the Ethernet destination address is to be extracted.
-     * @return The destination address of the Ethernet part of {@code packet}.
-     */
-    public static MacAddress getEthDstAddr(PcapPacket packet) {
-        return getEthernetPacketOrThrow(packet).getHeader().getDstAddr();
-    }
-
-    /**
-     * Determines if a given {@link PcapPacket} wraps a {@link TcpPacket}.
-     * @param packet The {@link PcapPacket} to inspect.
-     * @return {@code true} if {@code packet} wraps a {@link TcpPacket}, {@code false} otherwise.
-     */
-    public static boolean isTcp(PcapPacket packet) {
-        return packet.get(TcpPacket.class) != null;
-    }
-
-    /**
-     * Gets the source IP (in decimal format) of an IPv4 packet.
-     * @param packet The packet for which the IPv4 source address is to be extracted.
-     * @return The decimal representation of the source IP of {@code packet} <em>iff</em> {@code packet} wraps an
-     *         {@link IpV4Packet}.
-     * @throws NullPointerException if {@code packet} does not encapsulate an {@link IpV4Packet}.
-     */
-    public static String getSourceIp(PcapPacket packet) {
-        return getIpV4PacketOrThrow(packet).getHeader().getSrcAddr().getHostAddress();
-    }
-
-    /**
-     * Gets the destination IP (in decimal format) of an IPv4 packet.
-     * @param packet The packet for which the IPv4 source address is to be extracted.
-     * @return The decimal representation of the destination IP of {@code packet} <em>iff</em> {@code packet} wraps an
-     *         {@link IpV4Packet}.
-     * @throws NullPointerException if {@code packet} does not encapsulate an {@link IpV4Packet}.
-     */
-    public static String getDestinationIp(PcapPacket packet) {
-        return getIpV4PacketOrThrow(packet).getHeader().getDstAddr().getHostAddress();
-    }
-
-    /**
-     * Gets the source port of a TCP packet.
-     * @param packet The packet for which the source port is to be extracted.
-     * @return The source port of the {@link TcpPacket} encapsulated by {@code packet}.
-     * @throws IllegalArgumentException if {@code packet} does not encapsulate a {@link TcpPacket}.
-     */
-    public static int getSourcePort(PcapPacket packet) {
-        TcpPacket tcpPacket = packet.get(TcpPacket.class);
-        if (tcpPacket == null) {
-            throw new IllegalArgumentException("not a TCP packet");
-        }
-        return tcpPacket.getHeader().getSrcPort().valueAsInt();
-    }
-
-    /**
-     * Gets the destination port of a TCP packet.
-     * @param packet The packet for which the destination port is to be extracted.
-     * @return The destination port of the {@link TcpPacket} encapsulated by {@code packet}.
-     * @throws IllegalArgumentException if {@code packet} does not encapsulate a {@link TcpPacket}.
-     */
-    public static int getDestinationPort(PcapPacket packet) {
-        TcpPacket tcpPacket = packet.get(TcpPacket.class);
-        if (tcpPacket == null) {
-            throw new IllegalArgumentException("not a TCP packet");
-        }
-        return tcpPacket.getHeader().getDstPort().valueAsInt();
-    }
-
-    /**
-     * Helper method to determine if the given combination of IP and port matches the source of the given packet.
-     * @param packet The packet to check.
-     * @param ip The IP to look for in the ip.src field of {@code packet}.
-     * @param port The port to look for in the tcp.port field of {@code packet}.
-     * @return {@code true} if the given ip+port match the corresponding fields in {@code packet}.
-     */
-    public static boolean isSource(PcapPacket packet,         String ip, int port) {
-        IpV4Packet ipPacket = Objects.requireNonNull(packet.get(IpV4Packet.class));
-        // For now we only support TCP flows.
-        TcpPacket tcpPacket = Objects.requireNonNull(packet.get(TcpPacket.class));
-        String ipSrc = ipPacket.getHeader().getSrcAddr().getHostAddress();
-        int srcPort = tcpPacket.getHeader().getSrcPort().valueAsInt();
-        return ipSrc.equals(ip) && srcPort == port;
-    }
-
-    /**
-     * Helper method to determine if the given combination of IP and port matches the destination of the given packet.
-     * @param packet The packet to check.
-     * @param ip The IP to look for in the ip.dst field of {@code packet}.
-     * @param port The port to look for in the tcp.dstport field of {@code packet}.
-     * @return {@code true} if the given ip+port match the corresponding fields in {@code packet}.
-     */
-    public static boolean isDestination(PcapPacket packet, String ip, int port) {
-        IpV4Packet ipPacket = Objects.requireNonNull(packet.get(IpV4Packet.class));
-        // For now we only support TCP flows.
-        TcpPacket tcpPacket = Objects.requireNonNull(packet.get(TcpPacket.class));
-        String ipDst = ipPacket.getHeader().getDstAddr().getHostAddress();
-        int dstPort = tcpPacket.getHeader().getDstPort().valueAsInt();
-        return ipDst.equals(ip) && dstPort == port;
-    }
-
-    /**
-     * Checks if the source IP address of the {@link IpV4Packet} contained in {@code packet} is a local address, i.e.,
-     * if it pertains to subnet 10.0.0.0/8, 172.16.0.0/16, or 192.168.0.0/16.
-     * @param packet The packet for which the source IP address is to be examined.
-     * @return {@code true} if {@code packet} wraps a {@link IpV4Packet} for which the source IP address is a local IP
-     *         address, {@code false} otherwise.
-     * @throws NullPointerException if {@code packet} does not encapsulate an {@link IpV4Packet}.
-     */
-    public static boolean isSrcIpLocal(PcapPacket packet) {
-        return getIpV4PacketOrThrow(packet).getHeader().getSrcAddr().isSiteLocalAddress();
-    }
-
-    /**
-     * Checks if the destination IP address of the {@link IpV4Packet} contained in {@code packet} is a local address,
-     * i.e., if it pertains to subnet 10.0.0.0/8, 172.16.0.0/16, or 192.168.0.0/16.
-     * @param packet The packet for which the destination IP address is to be examined.
-     * @return {@code true} if {@code packet} wraps a {@link IpV4Packet} for which the destination IP address is a local
-     *         IP address, {@code false} otherwise.
-     * @throws NullPointerException if {@code packet} does not encapsulate an {@link IpV4Packet}.
-     */
-    public static boolean isDstIpLocal(PcapPacket packet) {
-        return getIpV4PacketOrThrow(packet).getHeader().getDstAddr().isSiteLocalAddress();
-    }
-
-    /**
-     * Checks if {@code packet} wraps a TCP packet that has the SYN flag set.
-     * @param packet A {@link PcapPacket} that is suspected to contain a {@link TcpPacket} for which the SYN flag is set.
-     * @return {@code true} <em>iff</em> {@code packet} contains a {@code TcpPacket} for which the SYN flag is set,
-     *         {@code false} otherwise.
-     */
-    public static boolean isSyn(PcapPacket packet) {
-        TcpPacket tcp = packet.get(TcpPacket.class);
-        return tcp != null && tcp.getHeader().getSyn();
-    }
-
-    /**
-     * Checks if {@code packet} wraps a TCP packet th        at has the ACK flag set.
-     * @param packet A {@link PcapPacket} that is suspected to contain a {@link TcpPacket} for which the ACK flag is set.
-     * @return {@code true} <em>iff</em> {@code packet} contains a {@code TcpPacket} for which the ACK flag is set,
-     *         {@code false} otherwise.
-     */
-    public static boolean isAck(PcapPacket packet) {
-        TcpPacket tcp = packet.get(TcpPacket.class);
-        return tcp != null && tcp.getHeader().getAck();
-    }
-
-    /**
-     * Transform a {@code Cluster} of {@code PcapPacketPair} objects into a {@code List} of {@code List} of
-     * {@code PcapPacket} objects.
-     * @param cluster A {@link Cluster} of {@link PcapPacketPair} objects that needs to be transformed.
-     * @return A {@link List} of {@link List} of {@link PcapPacket} objects as the result of the transformation.
-     */
-    public static List<List<PcapPacket>> clusterToListOfPcapPackets(Cluster<PcapPacketPair> cluster) {
-        List<List<PcapPacket>> ppListOfList = new ArrayList<>();
-        for (PcapPacketPair ppp: cluster.getPoints()) {
-            // Create a list of PcapPacket objects (list of two members).
-            List<PcapPacket> ppList = new ArrayList<>();
-            ppList.add(ppp.getFirst());
-            if(ppp.getSecond().isPresent())
-                ppList.add(ppp.getSecond().get());
-            else
-                ppList.add(null);
-            // Create a list of list of PcapPacket objects.
-            ppListOfList.add(ppList);
-        }
-        // Sort the list of lists based on the first packet's timestamp!
-        Collections.sort(ppListOfList, (p1, p2) -> p1.        get(0).getTimestamp().compareTo(p2.get(0).getTimestamp()));
-        return ppListOfList;
-    }
-
-    /**
-     * Merge signatures in {@code List} of {@code List} of {@code List} of {@code PcapPacket} objects.
-     * We cross-check these with {@code List} of {@code Conversation} objects to see
-     * if two {@code List} of {@code PcapPacket} objects actually belong to the same {@code Conversation}.
-     * @param signatures A {@link List} of {@link List} of {@link List} of
-     *          {@link PcapPacket} objects that needs to be checked and merged.
-     * @param conversations A {@link List} of {@link Conversation} objects as reference for merging.
-     * @return A {@link List} of {@link List} of {@link List} of
-     *          {@link PcapPacket} objects as the result of the merging.
-     */
-    public static List<List<List<PcapPacket>>>
-            mergeSignatures(List<List<List<PcapPacket>>> signatures, List<Conversation> conversations) {
-
-        // TODO: THIS IS NOT A DEEP COPY; IT BASICALLY CREATES A REFERENCE TO THE SAME LIST OBJECT
-        // List<List<List<PcapPacket>>> copySignatures = new ArrayList<>(signatures);
-        // Make a deep copy first.
-        List<List<List<PcapPacket>>> copySignatures = new ArrayList<>();
-        listDeepCopy(copySignatures, signatures);
-        // Traverse and look into the pairs of signatures.
-        for (int first = 0; first < signatures.size(); first++) {
-            List<List<PcapPacket>> firstList = signatures.get(first);
-            for (int second = first+1; second < signatures.size(); second++) {
-                int maxSignatureEl = 0; // Number of maximum signature elements.
-                List<List<PcapPacket>> secondList = signatures.get(second);
-                int initialSecondListMembers = secondList.size();
-                // Iterate over the signatures in the first list.
-                for (List<PcapPacket> signature : firstList) {
-                    signature.removeIf(el -> el == null); // Clean up null elements.
-                    // Return the Conversation that the signature is part of.
-                    Conversation conv = TcpConversationUtils.returnConversation(signature, conversations);
-                    // Find the element of the second list that is a match for that Conversation.
-                    for (List<PcapPacket> ppList : secondList) {
-                        ppList.removeIf(el -> el == null); // Clean up null elements.
-                        // Check if they are part of a Conversation and are adjacent to the first signature.
-                        // If yes then merge into the first list.
-                        TcpConversationUtils.SignaturePosition position =
-                                TcpConversationUtils.isPartOfConversationAndAdjacent(signature, ppList, conv);
-                        if (position == TcpConversationUtils.SignaturePosition.LEFT_ADJACENT) {
-                            // Merge to the left side of the first signature.
-                            ppList.addAll(signature);
-                            signature = ppList;
-                            maxSignatureEl = signature.size() > maxSignatureEl ? signature.size() : maxSignatureEl;
-                            secondList.remove(ppList); // Remove as we merge.
-                            break;
-                        } else if (position == TcpConversationUtils.SignaturePosition.RIGHT_ADJACENT) {
-                            // Merge to the right side of the first signature.
-                            signature.addAll(ppList);
-                            maxSignatureEl = signature.size() > maxSignatureEl ? signature.size() : maxSignatureEl;
-                            secondList.remove(ppList); // Remove as we merge.
-                            break;
-                        } // TcpConversationUtils.SignaturePosition.NOT_ADJACENT.
-                    }
-                }
-                // Call it a successful merging if there are only less than 5 elements from the second list that
-                // cannot be merged.
-                if (secondList.size() < SIGNATURE_MERGE_THRESHOLD) {
-                    // Prune the unsuccessfully merged signatures (i.e., these will have size() < maxSignatureEl).
-                    final int maxNumOfEl = maxSignatureEl;
-                    // TODO: DOUBLE CHECK IF WE REALLY NEED TO PRUNE FAILED BINDINGS
-                    // TODO: SOMETIMES THE SEQUENCES ARE JUST INCOMPLETE
-                    // TODO: AND BOTH THE COMPLETE AND INCOMPLETE SEQUENCES ARE VALID SIGNATURES!
-                    firstList.removeIf(el -> el.size() < maxNumOfEl);
-                    // Remove the merged set of signatures when successful.
-                    signatures.remove(secondList);
-                } else if (secondList.size() < initialSecondListMembers) {
-                    // If only some of the signatures from the second list are merged, this means UNSUCCESSFUL merging.
-                    // Return the original copy of the signatures object.
-                    return copySignatures;
-                }
-            }
-        }
-        return signatures;
-    }
-
-    /**
-     * Deep copy to create an entirely new {@link List} of {@link List} of {@link List} of {@link PcapPacket} objects.
-     * @param destList A {@link List} of {@link List} of {@link List} of
-     *          {@link PcapPacket} objects that will be the final container of the deep copy
-     * @param sourceList A {@link List} of {@link List} of {@link List} of
-     *          {@link PcapPacket} objects that will be the source of the deep copy.
-     */
-    private static void listDeepCopy(List<List<List<PcapPacket>>> destList, List<List<List<PcapPacket>>> sourceList) {
-
-        for(List<List<PcapPacket>> llPcapPacket : sourceList) {
-            List<List<PcapPacket>> tmpListOfList = new ArrayList<>();
-            for(List<PcapPacket> lPcapPacket : llPcapPacket) {
-                List<PcapPacket> tmpList = new ArrayList<>();
-                for(PcapPacket pcapPacket : lPcapPacket) {
-                    tmpList.add(pcapPacket);
-                }
-                tmpListOfList.add(tmpList);
-            }
-            destList.add(tmpListOfList);
-        }
-    }
-
-    /**
-     * Sort the signatures in the {@code List} of {@code List} of {@code List} of {@code PcapPacket} objects.
-     * The purpose of this is to sort the order of signatures in the signature list. For detection purposes, we need
-     * to know if one signature occurs earlier/later in time with respect to the other signatures for more confidence
-     * in detecting the occurrence of an event.
-     * @param signatures A {@code List} of {@code List} of {@code List} of {@code PcapPacket} objects that needs sorting.
-     *                   We assume that innermost {@code List} of {@code PcapPacket} objects have been sorted ascending
-     *                   by timestamps. By the time we use this method, we should have sorted it when calling the
-     *                   {@code clusterToListOfPcapPackets} method.
-     * @return A sorted {@code List} of {@code List} of {@code List} of {@code PcapPacket} objects.
-     */
-    public static List<List<List<PcapPacket>>> sortSignatures(List<List<List<PcapPacket>>> signatures) {
-        // TODO: This is the simplest solution!!! Might not cover all corner cases.
-        // TODO: Sort the list of lists based on the first packet's timestamps!
-//        Collections.sort(signatures, (p1, p2) -> {
-//            //return p1.get(0).get(0).getTimestamp().compareTo(p2.get(0).get(0).getTimestamp());
-//            int compare = p1.get(0).get(0).getTimestamp().compareTo(p2.get(0).get(0).getTimestamp());
-//            return compare;
-//        });
-        // TODO: The following is a more complete solution that covers corner cases.
-        // Sort the list of lists based on one-to-one comparison between timestamps of signatures on both lists.
-        // This also takes into account the fact that the number of signatures in the two lists could be different.
-        // Additionally, this code forces the comparison between two signatures only if they occur in the
-        // INCLUSION_WINDOW_MILLIS window; otherwise, it tries to find the right pair of signatures in the time window.
-        Collections.sort(signatures, (p1, p2) -> {
-            int compare = 0;
-            int comparePrev = 0;
-            int count1 = 0;
-            int count2 = 0;
-            // Need to make sure that both are not out of bound!
-            while (count1 + 1 < p1.size() && count2 + 1 < p2.size()) {
-                long timestamp1 = p1.get(count1).get(0).getTimestamp().toEpochMilli();
-                long timestamp2 = p2.get(count2).get(0).getTimestamp().toEpochMilli();
-                // The two timestamps have to be within a 15-second window!
-                if (Math.abs(timestamp1 - timestamp2) < TriggerTrafficExtractor.INCLUSION_WINDOW_MILLIS) {
-                    // If these two are within INCLUSION_WINDOW_MILLIS window then compare!
-                    compare = p1.get(count1).get(0).getTimestamp().compareTo(p2.get(count2).get(0).getTimestamp());
-//                    if (comparePrev != 0) { // First time since it is 0
-//                        if (Integer.signum(compare) != Integer.signum(comparePrev)) {
-//                            // Throw an exception if the order of the two signatures is not consistent,
-//                            // E.g., 111, 222, 333 in one occassion and 222, 333, 111 in the other.
-//                            throw new Error("OVERLAP WARNING: " + "" +
-//                                    "Please remove one of the sequences: " +
-//                                    p1.get(0).get(0).length() + "... OR " +
-//                                    p2.get(0).get(0).length() + "...");
-//                        }
-//                    }
-                    overlapChecking(compare, comparePrev, p1.get(count1), p2.get(count2));
-                    comparePrev = compare;
-                    count1++;
-                    count2++;
-                } else {
-                    // If not within INCLUSION_WINDOW_MILLIS window then find the correct pair
-                    // by incrementing one of them.
-                    if (timestamp1 < timestamp2)
-                        count1++;
-                    else
-                        count2++;
-                }
-            }
-            return compare;
-        });
-        return signatures;
-    }
-
-    /**
-     * Checks for overlapping between two packet sequences.
-     * @param compare Current comparison value between packet sequences p1 and p2
-     * @param comparePrev Previous comparison value between packet sequences p1 and p2
-     * @param sequence1 The packet sequence ({@link List} of {@link PcapPacket} objects).
-     * @param sequence2 The packet sequence ({@link List} of {@link PcapPacket} objects).
-     */
-    private static void overlapChecking(int compare, int comparePrev, List<PcapPacket> sequence1, List<PcapPacket> sequence2) {
-
-        // Check if p1 occurs before p2 but both have same overlap
-        if (comparePrev != 0) { // First time since it is 0
-            if (Integer.signum(compare) != Integer.signum(comparePrev)) {
-                // Throw an exception if the order of the two signatures is not consistent,
-                // E.g., 111, 222, 333 in one occassion and 222, 333, 111 in the other.
-                throw new Error("OVERLAP WARNING: " + "" +
-                        "Two sequences have some overlap. Please remove one of the sequences: " +
-                        sequence1.get(0).length() + "... OR " +
-                        sequence2.get(0).length() + "...");
-            }
-        }
-        // Check if p1 is longer than p2 and p2 occurs during the occurrence of p1
-        int lastIndexOfSequence1 = sequence1.size() - 1;
-        int lastIndexOfSequence2 = sequence2.size() - 1;
-        int compareLast =
-                sequence1.get(lastIndexOfSequence1).getTimestamp().compareTo(sequence2.get(lastIndexOfSequence2).getTimestamp());
-        // Check the signs of compare and compareLast
-        if ((compare <= 0 && compareLast > 0) ||
-            (compareLast <= 0 && compare > 0)) {
-            mOverlapCounter++;
-            // TODO: Probably not the best approach but we consider overlap if it happens more than once
-            if (mOverlapCounter > 1) {
-                throw new Error("OVERLAP WARNING: " + "" +
-                        "One sequence is in the other. Please remove one of the sequences: " +
-                        sequence1.get(0).length() + "... OR " +
-                        sequence2.get(0).length() + "...");
-            }
-        }
-
-    }
-
-    /**
-     * Gets the {@link IpV4Packet} contained in {@code packet}, or throws a {@link NullPointerException} if
-     * {@code packet} does not contain an {@link IpV4Packet}.
-     * @param packet A {@link PcapPacket} that is expected to contain an {@link IpV4Packet}.
-     * @return The {@link IpV4Packet} contained in {@code packet}.
-     * @throws NullPointerException if {@code packet} does not encapsulate an {@link IpV4Packet}.
-     */
-    private static IpV4Packet getIpV4PacketOrThrow(PcapPacket packet) {
-        return Objects.requireNonNull(packet.get(IpV4Packet.class), "not an IPv4 packet");
-    }
-
-    /**
-     * Gets the {@link EthernetPacket} contained in {@code packet}, or throws a {@link NullPointerException} if
-     * {@code packet} does not contain an {@link EthernetPacket}.
-     * @param packet A {@link PcapPacket} that is expected to contain an {@link EthernetPacket}.
-     * @return The {@link EthernetPacket} contained in {@code packet}.
-     * @throws NullPointerException if {@code packet} does not encapsulate an {@link EthernetPacket}.
-     */
-    private static final EthernetPacket getEthernetPacketOrThrow(PcapPacket packet) {
-        return Objects.requireNonNull(packet.get(EthernetPacket.class), "not an Ethernet packet");
-    }
-
-    /**
-     * Print signatures in {@code List} of {@code List} of {@code List} of {@code PcapPacket} objects.
-     *
-     * @param signatures A {@link List} of {@link List} of {@link List} of
-     *          {@link PcapPacket} objects that needs to be printed.
-     */
-    public static void printSignatures(List<List<List<PcapPacket>>> signatures) {
-
-        // Iterate over the list of all clusters/sequences
-        int sequenceCounter = 0;
-        for(List<List<PcapPacket>> listListPcapPacket : signatures) {
-            // Iterate over every member of a cluster/sequence
-            System.out.print("====== SEQUENCE " + ++sequenceCounter);
-            System.out.println(" - " + listListPcapPacket.size() + " MEMBERS ======");
-            for(List<PcapPacket> listPcapPacket : listListPcapPacket) {
-                // Print out packet lengths in a sequence
-                int packetCounter = 0;
-                for(PcapPacket pcapPacket : listPcapPacket) {
-                    if(pcapPacket != null) {
-                        System.out.print(pcapPacket.length());
-                    }
-                    if(packetCounter < listPcapPacket.size() - 1) {
-                        System.out.print(" ");  // Provide space if not last packet
-                    } else {
-                        System.out.println();      // Newline if last packet
-                    }
-                    packetCounter++;
-                }
-            }
-        }
-    }
-
-    /**
-     * Remove a sequence in a signature object.
-     *
-     * @param signatures A {@link List} of {@link List} of {@link List} of
-     *          {@link PcapPacket} objects.
-     * @param sequenceIndex An index for a sequence that consists of {{@link List} of {@link List} of
-     *          {@link PcapPacket} objects.
-     */
-    public static void removeSequenceFromSignature(List<List<List<PcapPacket>>> signatures, int sequenceIndex) {
-
-        // Sequence index starts from 0
-        signatures.remove(sequenceIndex);
-    }
-}