Code/Projects/SmartPlugDetector/src/main/java/edu/uci/iotproject/util/PcapPacketUtils.java

   1 package edu.uci.iotproject.util;
   2
   3 import edu.uci.iotproject.trafficreassembly.layer3.Conversation;
   4 import edu.uci.iotproject.analysis.PcapPacketPair;
   5 import edu.uci.iotproject.analysis.TcpConversationUtils;
   6 import edu.uci.iotproject.analysis.TriggerTrafficExtractor;
   7 import org.apache.commons.math3.stat.clustering.Cluster;
   8 import org.pcap4j.core.PcapPacket;
   9 import org.pcap4j.packet.EthernetPacket;
  10 import org.pcap4j.packet.IpV4Packet;
  11 import org.pcap4j.packet.TcpPacket;
  12 import org.pcap4j.util.MacAddress;
  13
  14 import java.util.*;
  15
  16 /**
  17  * Utility methods for inspecting {@link PcapPacket} properties.
  18  *
  19  * @author Janus Varmarken {@literal <jvarmark@uci.edu>}
  20  * @author Rahmadi Trimananda {@literal <rtrimana@uci.edu>}
  21  */
  22 public final class PcapPacketUtils {
  23
  24     /**
  25      * This is the threshold value for a signature's number of members
  26      * If after a merging the number of members of a signature falls below this threshold, then we can boldly
  27      * get rid of that signature.
  28      */
  29     private static final int SIGNATURE_MERGE_THRESHOLD = 5;
  30
  31     /**
  32      * This is an overlap counter (we consider overlaps between signatures if it happens more than once)
  33      */
  34     private static int mOverlapCounter = 0;
  35
  36
  37     /**
  38      * Gets the source address of the Ethernet part of {@code packet}.
  39      * @param packet The packet for which the Ethernet source address is to be extracted.
  40      * @return The source address of the Ethernet part of {@code packet}.
  41      */
  42     public static MacAddress getEthSrcAddr(PcapPacket packet) {
  43         return getEthernetPacketOrThrow(packet).getHeader().getSrcAddr();
  44     }
  45
  46     /**
  47      * Gets the destination address of the Ethernet part of {@code packet}.
  48      * @param packet The packet for which the Ethernet destination address is to be extracted.
  49      * @return The destination address of the Ethernet part of {@code packet}.
  50      */
  51     public static MacAddress getEthDstAddr(PcapPacket packet) {
  52         return getEthernetPacketOrThrow(packet).getHeader().getDstAddr();
  53     }
  54
  55     /**
  56      * Determines if a given {@link PcapPacket} wraps a {@link TcpPacket}.
  57      * @param packet The {@link PcapPacket} to inspect.
  58      * @return {@code true} if {@code packet} wraps a {@link TcpPacket}, {@code false} otherwise.
  59      */
  60     public static boolean isTcp(PcapPacket packet) {
  61         return packet.get(TcpPacket.class) != null;
  62     }
  63
  64     /**
  65      * Gets the source IP (in decimal format) of an IPv4 packet.
  66      * @param packet The packet for which the IPv4 source address is to be extracted.
  67      * @return The decimal representation of the source IP of {@code packet} <em>iff</em> {@code packet} wraps an
  68      *         {@link IpV4Packet}.
  69      * @throws NullPointerException if {@code packet} does not encapsulate an {@link IpV4Packet}.
  70      */
  71     public static String getSourceIp(PcapPacket packet) {
  72         return getIpV4PacketOrThrow(packet).getHeader().getSrcAddr().getHostAddress();
  73     }
  74
  75     /**
  76      * Gets the destination IP (in decimal format) of an IPv4 packet.
  77      * @param packet The packet for which the IPv4 source address is to be extracted.
  78      * @return The decimal representation of the destination IP of {@code packet} <em>iff</em> {@code packet} wraps an
  79      *         {@link IpV4Packet}.
  80      * @throws NullPointerException if {@code packet} does not encapsulate an {@link IpV4Packet}.
  81      */
  82     public static String getDestinationIp(PcapPacket packet) {
  83         return getIpV4PacketOrThrow(packet).getHeader().getDstAddr().getHostAddress();
  84     }
  85
  86     /**
  87      * Gets the source port of a TCP packet.
  88      * @param packet The packet for which the source port is to be extracted.
  89      * @return The source port of the {@link TcpPacket} encapsulated by {@code packet}.
  90      * @throws IllegalArgumentException if {@code packet} does not encapsulate a {@link TcpPacket}.
  91      */
  92     public static int getSourcePort(PcapPacket packet) {
  93         TcpPacket tcpPacket = packet.get(TcpPacket.class);
  94         if (tcpPacket == null) {
  95             throw new IllegalArgumentException("not a TCP packet");
  96         }
  97         return tcpPacket.getHeader().getSrcPort().valueAsInt();
  98     }
  99
 100     /**
 101      * Gets the destination port of a TCP packet.
 102      * @param packet The packet for which the destination port is to be extracted.
 103      * @return The destination port of the {@link TcpPacket} encapsulated by {@code packet}.
 104      * @throws IllegalArgumentException if {@code packet} does not encapsulate a {@link TcpPacket}.
 105      */
 106     public static int getDestinationPort(PcapPacket packet) {
 107         TcpPacket tcpPacket = packet.get(TcpPacket.class);
 108         if (tcpPacket == null) {
 109             throw new IllegalArgumentException("not a TCP packet");
 110         }
 111         return tcpPacket.getHeader().getDstPort().valueAsInt();
 112     }
 113
 114     /**
 115      * Helper method to determine if the given combination of IP and port matches the source of the given packet.
 116      * @param packet The packet to check.
 117      * @param ip The IP to look for in the ip.src field of {@code packet}.
 118      * @param port The port to look for in the tcp.port field of {@code packet}.
 119      * @return {@code true} if the given ip+port match the corresponding fields in {@code packet}.
 120      */
 121     public static boolean isSource(PcapPacket packet,         String ip, int port) {
 122         IpV4Packet ipPacket = Objects.requireNonNull(packet.get(IpV4Packet.class));
 123         // For now we only support TCP flows.
 124         TcpPacket tcpPacket = Objects.requireNonNull(packet.get(TcpPacket.class));
 125         String ipSrc = ipPacket.getHeader().getSrcAddr().getHostAddress();
 126         int srcPort = tcpPacket.getHeader().getSrcPort().valueAsInt();
 127         return ipSrc.equals(ip) && srcPort == port;
 128     }
 129
 130     /**
 131      * Helper method to determine if the given combination of IP and port matches the destination of the given packet.
 132      * @param packet The packet to check.
 133      * @param ip The IP to look for in the ip.dst field of {@code packet}.
 134      * @param port The port to look for in the tcp.dstport field of {@code packet}.
 135      * @return {@code true} if the given ip+port match the corresponding fields in {@code packet}.
 136      */
 137     public static boolean isDestination(PcapPacket packet, String ip, int port) {
 138         IpV4Packet ipPacket = Objects.requireNonNull(packet.get(IpV4Packet.class));
 139         // For now we only support TCP flows.
 140         TcpPacket tcpPacket = Objects.requireNonNull(packet.get(TcpPacket.class));
 141         String ipDst = ipPacket.getHeader().getDstAddr().getHostAddress();
 142         int dstPort = tcpPacket.getHeader().getDstPort().valueAsInt();
 143         return ipDst.equals(ip) && dstPort == port;
 144     }
 145
 146     /**
 147      * Checks if the source IP address of the {@link IpV4Packet} contained in {@code packet} is a local address, i.e.,
 148      * if it pertains to subnet 10.0.0.0/8, 172.16.0.0/16, or 192.168.0.0/16.
 149      * @param packet The packet for which the source IP address is to be examined.
 150      * @return {@code true} if {@code packet} wraps a {@link IpV4Packet} for which the source IP address is a local IP
 151      *         address, {@code false} otherwise.
 152      * @throws NullPointerException if {@code packet} does not encapsulate an {@link IpV4Packet}.
 153      */
 154     public static boolean isSrcIpLocal(PcapPacket packet) {
 155         return getIpV4PacketOrThrow(packet).getHeader().getSrcAddr().isSiteLocalAddress();
 156     }
 157
 158     /**
 159      * Checks if the destination IP address of the {@link IpV4Packet} contained in {@code packet} is a local address,
 160      * i.e., if it pertains to subnet 10.0.0.0/8, 172.16.0.0/16, or 192.168.0.0/16.
 161      * @param packet The packet for which the destination IP address is to be examined.
 162      * @return {@code true} if {@code packet} wraps a {@link IpV4Packet} for which the destination IP address is a local
 163      *         IP address, {@code false} otherwise.
 164      * @throws NullPointerException if {@code packet} does not encapsulate an {@link IpV4Packet}.
 165      */
 166     public static boolean isDstIpLocal(PcapPacket packet) {
 167         return getIpV4PacketOrThrow(packet).getHeader().getDstAddr().isSiteLocalAddress();
 168     }
 169
 170     /**
 171      * Checks if {@code packet} wraps a TCP packet that has the SYN flag set.
 172      * @param packet A {@link PcapPacket} that is suspected to contain a {@link TcpPacket} for which the SYN flag is set.
 173      * @return {@code true} <em>iff</em> {@code packet} contains a {@code TcpPacket} for which the SYN flag is set,
 174      *         {@code false} otherwise.
 175      */
 176     public static boolean isSyn(PcapPacket packet) {
 177         TcpPacket tcp = packet.get(TcpPacket.class);
 178         return tcp != null && tcp.getHeader().getSyn();
 179     }
 180
 181     /**
 182      * Checks if {@code packet} wraps a TCP packet th        at has the ACK flag set.
 183      * @param packet A {@link PcapPacket} that is suspected to contain a {@link TcpPacket} for which the ACK flag is set.
 184      * @return {@code true} <em>iff</em> {@code packet} contains a {@code TcpPacket} for which the ACK flag is set,
 185      *         {@code false} otherwise.
 186      */
 187     public static boolean isAck(PcapPacket packet) {
 188         TcpPacket tcp = packet.get(TcpPacket.class);
 189         return tcp != null && tcp.getHeader().getAck();
 190     }
 191
 192     /**
 193      * Transform a {@code Cluster} of {@code PcapPacketPair} objects into a {@code List} of {@code List} of
 194      * {@code PcapPacket} objects.
 195      * @param cluster A {@link Cluster} of {@link PcapPacketPair} objects that needs to be transformed.
 196      * @return A {@link List} of {@link List} of {@link PcapPacket} objects as the result of the transformation.
 197      */
 198     public static List<List<PcapPacket>> clusterToListOfPcapPackets(Cluster<PcapPacketPair> cluster) {
 199         List<List<PcapPacket>> ppListOfList = new ArrayList<>();
 200         for (PcapPacketPair ppp: cluster.getPoints()) {
 201             // Create a list of PcapPacket objects (list of two members).
 202             List<PcapPacket> ppList = new ArrayList<>();
 203             ppList.add(ppp.getFirst());
 204             if(ppp.getSecond().isPresent())
 205                 ppList.add(ppp.getSecond().get());
 206             else
 207                 ppList.add(null);
 208             // Create a list of list of PcapPacket objects.
 209             ppListOfList.add(ppList);
 210         }
 211         // Sort the list of lists based on the first packet's timestamp!
 212         Collections.sort(ppListOfList, (p1, p2) -> p1.        get(0).getTimestamp().compareTo(p2.get(0).getTimestamp()));
 213         return ppListOfList;
 214     }
 215
 216     /**
 217      * Merge signatures in {@code List} of {@code List} of {@code List} of {@code PcapPacket} objects.
 218      * We cross-check these with {@code List} of {@code Conversation} objects to see
 219      * if two {@code List} of {@code PcapPacket} objects actually belong to the same {@code Conversation}.
 220      * @param signatures A {@link List} of {@link List} of {@link List} of
 221      *          {@link PcapPacket} objects that needs to be checked and merged.
 222      * @param conversations A {@link List} of {@link Conversation} objects as reference for merging.
 223      * @return A {@link List} of {@link List} of {@link List} of
 224      *          {@link PcapPacket} objects as the result of the merging.
 225      */
 226     public static List<List<List<PcapPacket>>>
 227             mergeSignatures(List<List<List<PcapPacket>>> signatures, List<Conversation> conversations) {
 228
 229         // TODO: THIS IS NOT A DEEP COPY; IT BASICALLY CREATES A REFERENCE TO THE SAME LIST OBJECT
 230         // List<List<List<PcapPacket>>> copySignatures = new ArrayList<>(signatures);
 231         // Make a deep copy first.
 232         List<List<List<PcapPacket>>> copySignatures = new ArrayList<>();
 233         listDeepCopy(copySignatures, signatures);
 234         // Traverse and look into the pairs of signatures.
 235         for (int first = 0; first < signatures.size(); first++) {
 236             List<List<PcapPacket>> firstList = signatures.get(first);
 237             for (int second = first+1; second < signatures.size(); second++) {
 238                 int maxSignatureEl = 0; // Number of maximum signature elements.
 239                 List<List<PcapPacket>> secondList = signatures.get(second);
 240                 int initialSecondListMembers = secondList.size();
 241                 // Iterate over the signatures in the first list.
 242                 for (List<PcapPacket> signature : firstList) {
 243                     signature.removeIf(el -> el == null); // Clean up null elements.
 244                     // Return the Conversation that the signature is part of.
 245                     Conversation conv = TcpConversationUtils.returnConversation(signature, conversations);
 246                     // Find the element of the second list that is a match for that Conversation.
 247                     for (List<PcapPacket> ppList : secondList) {
 248                         ppList.removeIf(el -> el == null); // Clean up null elements.
 249                         // Check if they are part of a Conversation and are adjacent to the first signature.
 250                         // If yes then merge into the first list.
 251                         TcpConversationUtils.SignaturePosition position =
 252                                 TcpConversationUtils.isPartOfConversationAndAdjacent(signature, ppList, conv);
 253                         if (position == TcpConversationUtils.SignaturePosition.LEFT_ADJACENT) {
 254                             // Merge to the left side of the first signature.
 255                             ppList.addAll(signature);
 256                             signature = ppList;
 257                             maxSignatureEl = signature.size() > maxSignatureEl ? signature.size() : maxSignatureEl;
 258                             secondList.remove(ppList); // Remove as we merge.
 259                             break;
 260                         } else if (position == TcpConversationUtils.SignaturePosition.RIGHT_ADJACENT) {
 261                             // Merge to the right side of the first signature.
 262                             signature.addAll(ppList);
 263                             maxSignatureEl = signature.size() > maxSignatureEl ? signature.size() : maxSignatureEl;
 264                             secondList.remove(ppList); // Remove as we merge.
 265                             break;
 266                         } // TcpConversationUtils.SignaturePosition.NOT_ADJACENT.
 267                     }
 268                 }
 269                 // Call it a successful merging if there are only less than 5 elements from the second list that
 270                 // cannot be merged.
 271                 if (secondList.size() < SIGNATURE_MERGE_THRESHOLD) {
 272                     // Prune the unsuccessfully merged signatures (i.e., these will have size() < maxSignatureEl).
 273                     final int maxNumOfEl = maxSignatureEl;
 274                     // TODO: DOUBLE CHECK IF WE REALLY NEED TO PRUNE FAILED BINDINGS
 275                     // TODO: SOMETIMES THE SEQUENCES ARE JUST INCOMPLETE
 276                     // TODO: AND BOTH THE COMPLETE AND INCOMPLETE SEQUENCES ARE VALID SIGNATURES!
 277                     firstList.removeIf(el -> el.size() < maxNumOfEl);
 278                     // Remove the merged set of signatures when successful.
 279                     signatures.remove(secondList);
 280                 } else if (secondList.size() < initialSecondListMembers) {
 281                     // If only some of the signatures from the second list are merged, this means UNSUCCESSFUL merging.
 282                     // Return the original copy of the signatures object.
 283                     return copySignatures;
 284                 }
 285             }
 286         }
 287         return signatures;
 288     }
 289
 290     /**
 291      * Deep copy to create an entirely new {@link List} of {@link List} of {@link List} of {@link PcapPacket} objects.
 292      * @param destList A {@link List} of {@link List} of {@link List} of
 293      *          {@link PcapPacket} objects that will be the final container of the deep copy
 294      * @param sourceList A {@link List} of {@link List} of {@link List} of
 295      *          {@link PcapPacket} objects that will be the source of the deep copy.
 296      */
 297     private static void listDeepCopy(List<List<List<PcapPacket>>> destList, List<List<List<PcapPacket>>> sourceList) {
 298
 299         for(List<List<PcapPacket>> llPcapPacket : sourceList) {
 300             List<List<PcapPacket>> tmpListOfList = new ArrayList<>();
 301             for(List<PcapPacket> lPcapPacket : llPcapPacket) {
 302                 List<PcapPacket> tmpList = new ArrayList<>();
 303                 for(PcapPacket pcapPacket : lPcapPacket) {
 304                     tmpList.add(pcapPacket);
 305                 }
 306                 tmpListOfList.add(tmpList);
 307             }
 308             destList.add(tmpListOfList);
 309         }
 310     }
 311
 312     /**
 313      * Sort the signatures in the {@code List} of {@code List} of {@code List} of {@code PcapPacket} objects.
 314      * The purpose of this is to sort the order of signatures in the signature list. For detection purposes, we need
 315      * to know if one signature occurs earlier/later in time with respect to the other signatures for more confidence
 316      * in detecting the occurrence of an event.
 317      * @param signatures A {@code List} of {@code List} of {@code List} of {@code PcapPacket} objects that needs sorting.
 318      *                   We assume that innermost {@code List} of {@code PcapPacket} objects have been sorted ascending
 319      *                   by timestamps. By the time we use this method, we should have sorted it when calling the
 320      *                   {@code clusterToListOfPcapPackets} method.
 321      * @return A sorted {@code List} of {@code List} of {@code List} of {@code PcapPacket} objects.
 322      */
 323     public static List<List<List<PcapPacket>>> sortSignatures(List<List<List<PcapPacket>>> signatures) {
 324         // TODO: This is the simplest solution!!! Might not cover all corner cases.
 325         // TODO: Sort the list of lists based on the first packet's timestamps!
 326 //        Collections.sort(signatures, (p1, p2) -> {
 327 //            //return p1.get(0).get(0).getTimestamp().compareTo(p2.get(0).get(0).getTimestamp());
 328 //            int compare = p1.get(0).get(0).getTimestamp().compareTo(p2.get(0).get(0).getTimestamp());
 329 //            return compare;
 330 //        });
 331         // TODO: The following is a more complete solution that covers corner cases.
 332         // Sort the list of lists based on one-to-one comparison between timestamps of signatures on both lists.
 333         // This also takes into account the fact that the number of signatures in the two lists could be different.
 334         // Additionally, this code forces the comparison between two signatures only if they occur in the
 335         // INCLUSION_WINDOW_MILLIS window; otherwise, it tries to find the right pair of signatures in the time window.
 336         Collections.sort(signatures, (p1, p2) -> {
 337             int compare = 0;
 338             int comparePrev = 0;
 339             int count1 = 0;
 340             int count2 = 0;
 341             // Need to make sure that both are not out of bound!
 342             while (count1 + 1 < p1.size() && count2 + 1 < p2.size()) {
 343                 long timestamp1 = p1.get(count1).get(0).getTimestamp().toEpochMilli();
 344                 long timestamp2 = p2.get(count2).get(0).getTimestamp().toEpochMilli();
 345                 // The two timestamps have to be within a 15-second window!
 346                 if (Math.abs(timestamp1 - timestamp2) < TriggerTrafficExtractor.INCLUSION_WINDOW_MILLIS) {
 347                     // If these two are within INCLUSION_WINDOW_MILLIS window then compare!
 348                     compare = p1.get(count1).get(0).getTimestamp().compareTo(p2.get(count2).get(0).getTimestamp());
 349 //                    if (comparePrev != 0) { // First time since it is 0
 350 //                        if (Integer.signum(compare) != Integer.signum(comparePrev)) {
 351 //                            // Throw an exception if the order of the two signatures is not consistent,
 352 //                            // E.g., 111, 222, 333 in one occassion and 222, 333, 111 in the other.
 353 //                            throw new Error("OVERLAP WARNING: " + "" +
 354 //                                    "Please remove one of the sequences: " +
 355 //                                    p1.get(0).get(0).length() + "... OR " +
 356 //                                    p2.get(0).get(0).length() + "...");
 357 //                        }
 358 //                    }
 359                     overlapChecking(compare, comparePrev, p1.get(count1), p2.get(count2));
 360                     comparePrev = compare;
 361                     count1++;
 362                     count2++;
 363                 } else {
 364                     // If not within INCLUSION_WINDOW_MILLIS window then find the correct pair
 365                     // by incrementing one of them.
 366                     if (timestamp1 < timestamp2)
 367                         count1++;
 368                     else
 369                         count2++;
 370                 }
 371             }
 372             return compare;
 373         });
 374         return signatures;
 375     }
 376
 377     /**
 378      * Checks for overlapping between two packet sequences.
 379      * @param compare Current comparison value between packet sequences p1 and p2
 380      * @param comparePrev Previous comparison value between packet sequences p1 and p2
 381      * @param sequence1 The packet sequence ({@link List} of {@link PcapPacket} objects).
 382      * @param sequence2 The packet sequence ({@link List} of {@link PcapPacket} objects).
 383      */
 384     private static void overlapChecking(int compare, int comparePrev, List<PcapPacket> sequence1, List<PcapPacket> sequence2) {
 385
 386         // Check if p1 occurs before p2 but both have same overlap
 387         if (comparePrev != 0) { // First time since it is 0
 388             if (Integer.signum(compare) != Integer.signum(comparePrev)) {
 389                 // Throw an exception if the order of the two signatures is not consistent,
 390                 // E.g., 111, 222, 333 in one occassion and 222, 333, 111 in the other.
 391                 throw new Error("OVERLAP WARNING: " + "" +
 392                         "Two sequences have some overlap. Please remove one of the sequences: " +
 393                         sequence1.get(0).length() + "... OR " +
 394                         sequence2.get(0).length() + "...");
 395             }
 396         }
 397         // Check if p1 is longer than p2 and p2 occurs during the occurrence of p1
 398         int lastIndexOfSequence1 = sequence1.size() - 1;
 399         int lastIndexOfSequence2 = sequence2.size() - 1;
 400         int compareLast =
 401                 sequence1.get(lastIndexOfSequence1).getTimestamp().compareTo(sequence2.get(lastIndexOfSequence2).getTimestamp());
 402         // Check the signs of compare and compareLast
 403         if ((compare <= 0 && compareLast > 0) ||
 404             (compareLast <= 0 && compare > 0)) {
 405             mOverlapCounter++;
 406             // TODO: Probably not the best approach but we consider overlap if it happens more than once
 407             if (mOverlapCounter > 1) {
 408                 throw new Error("OVERLAP WARNING: " + "" +
 409                         "One sequence is in the other. Please remove one of the sequences: " +
 410                         sequence1.get(0).length() + "... OR " +
 411                         sequence2.get(0).length() + "...");
 412             }
 413         }
 414
 415     }
 416
 417     /**
 418      * Gets the {@link IpV4Packet} contained in {@code packet}, or throws a {@link NullPointerException} if
 419      * {@code packet} does not contain an {@link IpV4Packet}.
 420      * @param packet A {@link PcapPacket} that is expected to contain an {@link IpV4Packet}.
 421      * @return The {@link IpV4Packet} contained in {@code packet}.
 422      * @throws NullPointerException if {@code packet} does not encapsulate an {@link IpV4Packet}.
 423      */
 424     private static IpV4Packet getIpV4PacketOrThrow(PcapPacket packet) {
 425         return Objects.requireNonNull(packet.get(IpV4Packet.class), "not an IPv4 packet");
 426     }
 427
 428     /**
 429      * Gets the {@link EthernetPacket} contained in {@code packet}, or throws a {@link NullPointerException} if
 430      * {@code packet} does not contain an {@link EthernetPacket}.
 431      * @param packet A {@link PcapPacket} that is expected to contain an {@link EthernetPacket}.
 432      * @return The {@link EthernetPacket} contained in {@code packet}.
 433      * @throws NullPointerException if {@code packet} does not encapsulate an {@link EthernetPacket}.
 434      */
 435     private static final EthernetPacket getEthernetPacketOrThrow(PcapPacket packet) {
 436         return Objects.requireNonNull(packet.get(EthernetPacket.class), "not an Ethernet packet");
 437     }
 438
 439     /**
 440      * Print signatures in {@code List} of {@code List} of {@code List} of {@code PcapPacket} objects.
 441      *
 442      * @param signatures A {@link List} of {@link List} of {@link List} of
 443      *          {@link PcapPacket} objects that needs to be printed.
 444      */
 445     public static void printSignatures(List<List<List<PcapPacket>>> signatures) {
 446
 447         // Iterate over the list of all clusters/sequences
 448         int sequenceCounter = 0;
 449         for(List<List<PcapPacket>> listListPcapPacket : signatures) {
 450             // Iterate over every member of a cluster/sequence
 451             System.out.print("====== SEQUENCE " + ++sequenceCounter);
 452             System.out.println(" - " + listListPcapPacket.size() + " MEMBERS ======");
 453             for(List<PcapPacket> listPcapPacket : listListPcapPacket) {
 454                 // Print out packet lengths in a sequence
 455                 int packetCounter = 0;
 456                 for(PcapPacket pcapPacket : listPcapPacket) {
 457                     if(pcapPacket != null) {
 458                         System.out.print(pcapPacket.length());
 459                     }
 460                     if(packetCounter < listPcapPacket.size() - 1) {
 461                         System.out.print(" ");  // Provide space if not last packet
 462                     } else {
 463                         System.out.println();      // Newline if last packet
 464                     }
 465                     packetCounter++;
 466                 }
 467             }
 468         }
 469     }
 470
 471     /**
 472      * Remove a sequence in a signature object.
 473      *
 474      * @param signatures A {@link List} of {@link List} of {@link List} of
 475      *          {@link PcapPacket} objects.
 476      * @param sequenceIndex An index for a sequence that consists of {{@link List} of {@link List} of
 477      *          {@link PcapPacket} objects.
 478      */
 479     public static void removeSequenceFromSignature(List<List<List<PcapPacket>>> signatures, int sequenceIndex) {
 480
 481         // Sequence index starts from 0
 482         signatures.remove(sequenceIndex);
 483     }
 484 }