fix a bug introducing redundant method entries for analysis
[IRC.git] / Robust / src / buildscript
index d81958a61735127ab80b7702193306d9ba043877..dbef4861556d0d5572ae4376e58f0d821c817f81 100755 (executable)
@@ -16,6 +16,46 @@ echo "-hybrid use fission only when it looks like a good choice"
 echo "-numa numa aware"
 echo "-eventmonitor turn on transaction event trace recording"
 echo
+echo OOOJava options
+echo -coreprof, turn on profiling API
+echo -coreprof-eventwords NUM, space in words/thread for coreprof events
+echo -coreprof-checkoverflow, ONLY use for debugging event overflow
+echo -coreprof-enable EVENTNAME, only enable desired events to reduce overhead
+echo   EVENTNAME can be: cpe_main, cpe_runmalloc, cpe_runfree, cpe_poolalloc, cpe_count_poolalloc, cpe_count_poolreuse, cpe_workschedgrab, cpe_taskdispatch, cpe_preparememq, cpe_taskexecute, cpe_taskretire, cpe_taskstallvar, cpe_taskstallmem 
+echo "-ooojava <numberofcores> <maxseseage>"
+echo -ooodebug general OOOJava debugging messages
+echo -ooodebug-disable-task-mem-pool this is a tricky module, disable for simpler runtime
+echo -mempool-detect-misuse turn on to find code misusing pool-allocated records
+echo -rcr turn on runtime conflict resolver
+echo -rcr_debug Shows weakly connected heaproots and which allocation sites were considered for traversal
+echo -rcr_debug_verbose in addition to above, also prints out effects passed in, internal representation of effects, and internal representation of reach graph
+echo -squeue use single queue
+echo -corepin use core pinning
+echo -nostalltr turn off RCR traversers that only handle conflicts between task and stallsite
+echo -nolock turn off synchronization lock
+echo
+echo Disjoint Reachability Analysis options
+echo -disjoint enable analysis
+echo -disjoint-k set k-limit for heap nodes per allocation site
+echo "-disjoint-write-dots <all/final> write reach graphs for all method sols. or only final sols."
+echo -disjoint-write-initial-contexts write reach graphs for callee initial contexts from all call sites
+echo -disjoint-write-ihms write reach graphs for each call site\'s Initial Heap Model
+echo "-disjoint-alias-file <filename> <normal/tabbed> write sharing for normal human reading or LaTeX tabbed"
+echo "-disjoint-debug-callsite <callee> <caller> <visit to start> <num caps> <T/F stop after>"
+echo "  To debug call site, give callee caller symbols (ie foo) the analysis visit to start capturing, num captures to take, and whether to halt analysis after capturing"
+echo "-disjoint-debug-snap-method <method> <visit to start> <num caps> <T/F stop after>"
+echo "  To take snapshots at statements, give method symbol, the analysis visit to start capturing, num captures to take, and whether to halt analsyis after capturing"
+echo "-disjoint-dvisit-stack use stack strat to visit descriptors (tasks or methods)"
+echo -disjoint-dvisit-stack-callees-on-top alternate stack strat
+echo -disjoint-dvisit-pqueue use prio. q strat to visit descriptors
+echo -disjoint-desire-determinism set above interproc for determinism
+echo -disjoint-debug-scheduling debug when methods are scheduled for analysis
+echo
+echo -pointsto-check-v-runtime check allocation site of pointer targets at runtime to help verify heap analysis results
+echo 
+echo "-mlp <num cores> <max sese age> build mlp code"
+echo -mlpdebug if mlp, report progress and interim results
+echo
 echo DSM options
 echo -dsm distributed shared memory
 echo -abortreaders abort readers immediately
@@ -24,31 +64,55 @@ echo -dsmcaching -enable caching in dsm runtime
 echo
 echo BAMBOO Multicore options
 echo -scheduling do task scheduling
+echo "-distributioninfo  execute to collect distribution info for simulated annealing in multi-core version"
+echo "-disall  execute to collect whole distribution"
+echo "-disstart specify the start number of distribution information collection"
 echo -multicore generate multi-core version binary
 echo "-numcore set the number of cores (should be used together with -multicore), defaultly set as 1"
-echo "-cacheflush enable cache flush in raw version binary (should be used togethere with -raw)"
 echo "-interrupt generate raw version binary with interruption (should be used togethere with -raw)"
 echo "-rawpath print out execute path information for raw version (should be used together with -raw)"
 echo "-useprofile use profiling data for scheduling (should be used together with -raw)"
 echo -printscheduling print out scheduling graphs
 echo -printschedulesim print out scheduling simulator result graphs
-echo -abcclose close the array boundary check
 echo "-tilera_bme generate tilera version binary for Bare Mental Environment (should be used together with -multicore"
 echo "-tilera_zlinux generate tilera version binary for Zero-Overhead Linux with multi-process mode (should be used together with -multicore"
 echo "-tileraconfig config tilera simulator/pci as nxm (should be used together with -tilera)"
 echo "-raw generate raw version binary (should be used together with -multicore)"
 echo "-rawconfig config raw simulator as 4xn (should be used together with -raw)"
+echo "-tilera_memprof build the memprof version (should be used together with -tilera_xx) "
+echo -accurateprofile build with accurate profile information including pre/post task processing info
+echo -profile_interrupt build with profile information of interrupts
+echo "-useio use standard io to output profiling data (should be used together with -raw and -profile), it only works with single core version"
+echo
+echo Multicore GC options
+echo -perfcount performance counters
 echo -multicoregc generate multi-core binary with garbage collection
+echo -pmc parallel collector
 echo "-numcore4gc set the number of cores for gc (should be used together with -multicoregc), defaultly set as 0"
 echo "-gcmem_local set the gc shared memory allocation strategy as local (should be used together with -multicoregc)"
 echo "-gcmem_fixed set the gc shared memory allocation strategy as fixed (should be used together with -multicoregc)"
 echo "-gcmem_mixed set the gc shared memory allocation strategy as mixed (should be used together with -multicoregc)"
 echo "-gcmem_global set the gc shared memory allocation strategy as global (should be used together with -multicoregc)"
+echo "-gccache_local set the gc shared memory cache strategy as local (should be used together with -multicoregc)"
+echo "-gccache_ran set the gc shared memory cache strategy as random (should be used together with -multicoregc)"
+echo "-gccontroller_near set the gc shared memory to use the nearest controller for each core (should be used together with -multicoregc)"
+echo "-gccontroller_remote set the gc shared memory to use a remote controller for each core (should be used together with -multicoregc)"
+echo "-gcsmallpagesize(2) set the gc shared memory to use small page size (should be used together with -multicoregc)"
+echo "-gclargepagesize set the gc shared memory to use large page size (should be used together with -multicoregc)"
+echo "-gclargesharedheap(2) set the gc shared memory as large (should be used together with -multicoregc)"
+echo "-gccacheadapt setup as cacheadaptable mode (should be used together with -multicoregc)"
 echo -gcprofile build with gcprofile options
-echo -accurateprofile build with accurate profile information including pre/post task processing info
-echo "-useio use standard io to output profiling data (should be used together with -raw and -profile), it only works with single core version"
+echo -mgc generate Multicore GC binary without task stuff
+echo -objectlockdebug generate OBJECT_LOCK_DEBUG code
+echo -gctbldebug generate GC_TBL_DEBUG code
+echo
+echo SSJava options
+echo -ssjava enables SSJava
+echo -ssjavadebug reports interim results
 echo
 echo Other options
+echo -jni enable jni
+echo -abcclose turnoff array boundary checks
 echo -builddir setup different build directory
 echo -robustroot set up the ROBUSTROOT to directory other than default one
 echo -readset turn on readset
@@ -58,6 +122,7 @@ echo -dmalloc link in dmalloc
 echo -64bit compile for 64 bit machine
 echo -32bit compile for 32 bit machine
 echo -joptimize java compiler optimizations
+echo -noloop turnoff loop optimizations
 echo -recover compile task code
 echo -fastcheck fast checkpointing for Bristlecone
 echo -specdir directory
@@ -69,6 +134,7 @@ echo -tagstate do tag state analysis
 echo -optional enable optional
 echo -debug generate debug symbols
 echo -prefetch do prefetch analysis
+echo -heapsize-mb NUM  set initial heap size in MB, default is 256
 echo -garbagestats Print garbage collection statistics
 echo -webinterface enable web interface
 echo -runtimedebug printout runtime debug messages
@@ -83,17 +149,21 @@ echo -instructionfailures inject code for instructionfailures
 echo -profile build with profile options
 echo "-enable-assertions execute assert statements during compilation"
 echo -justanalyze exit after compiler analyses complete
-echo "-distributioninfo  execute to collect distribution info for simulated annealing in multi-core version"
-echo "-disall  execute to collect whole distribution"
-echo "-disstart specify the start number of distribution information collection"
 echo -assembly generate assembly
 echo -recovery compile recovery code
 echo -dsmtask support work and task class library
 echo -recoverystats print out recovery record 
+echo -src-after-pp prints source code after preprocessor to tmp.c
+echo -capture-null-dereferences generates code to warn before derefencing null
+echo -printlinenum print out line numbers in generated C codes
 echo -help help
 }
 
 tmpbuilddirectory="tmpbuilddirectory"
+JNI=false
+SSJAVA=false
+SRCAFTERPP=false;
+COREPROF=false;
 NUMA=false;
 SANDBOX=false;
 ABORTREADERS=false;
@@ -103,6 +173,7 @@ STMRUNTIME=$ROBUSTROOT/Runtime/STM/
 DSMRECOVERYRUNTIME=$ROBUSTROOT/Runtime/DSTM/interface_recovery/
 REPAIRROOT=~/research/Repair/RepairCompiler/
 CURDIR=`pwd`
+SQUEUE=false
 DSMFLAG=false
 DSMRECOVERY=false
 FASTMEMCPY=false
@@ -114,28 +185,54 @@ NOJAVA=false
 CHECKFLAG=false
 RECOVERFLAG=false
 MLP_ON=false
+RCR=false
+RCR_DEBUG=false
+RCR_DEBUG_VERBOSE=false
 MLPDEBUG=false
 MULTICOREFLAG=false
 RAWFLAG=false
 TILERAFLAG=false
 TILERABMEFLAG=false
 TILERAZLINUXFLAG=false
+TILERAMEMPROFFLAG=false
 TILERACONFIG=''
-CACHEFLUSHFLAG=false
+TILERACORES=''
 RAWCONFIG=''
 DEBUGFLAG=false
 RAWPATHFLAG=false
 PROFILEFLAG=false
 GCPROFILEFLAG=false
+GCPROFILESFLAG=false
 ACCURATEPROFILEFLAG=false
+PROFILEINTERRUPTFLAG=false
 USEIOFLAG=false
 INTERRUPTFLAG=false
 THREADSIMULATEFLAG=false;
 MULTICOREGCFLAG=false;
+PERFCOUNT=false;
+PMCFLAG=false;
 GCMEMLOCALFLAG=false;
 GCMEMFIXEDFLAG=false;
 GCMEMMIXEDFLAG=false;
 GCMEMGLOBALFLAG=false;
+GCCACHELOCALFLAG=false;
+GCCACHERANFLAG=false;
+GCCONTROLLERNEARFLAG=false;
+GCCONTROLLERREMOTEFLAG=false;
+GCSMALLPAGESIZEFLAG=false;
+GCLARGEPAGESIZEFLAG=false;
+GCLARGEPAGESIZE2FLAG=false;
+GCLARGESHAREDHEAPFLAG=false;
+GCSMALLPAGESIZEFLAG2=false;
+GCLARGESHAREDHEAPFLAG2=false;
+GCCACHEADAPTFLAG=false
+GCCACHEADAPTPOLICYFLAG=false
+GCCACHEADAPTPOLICY=''
+GCCACHESAMPLINGFLAG=false
+MGCFLAG=false
+MGCINTELFLAG=false
+OBJECTLOCKDEBUGFLAG=false
+GCTBLDEBUGFLAG=false
 USEDMALLOC=false
 THREADFLAG=false
 FASTCHECK=false
@@ -149,8 +246,8 @@ OPTIONALFLAG=false
 EXITAFTERANALYSIS=false
 ASSEMBLY=false
 GCCORES=''
-GC1COREFLAG=false
 TILERAN1COREFLAG=false
+TILERA56COREFLAG=false
 
 if [[ -z $1 ]]
 then
@@ -164,9 +261,21 @@ if [[ $1 = '-help' ]]
 then
 printhelp
 exit
+elif [[ $1 = '-jni' ]]
+then
+JNI=true
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -jni"
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DJNI -I$ROBUSTROOT/Runtime/jni"
 elif [[ $1 = '-justanalyze' ]]
 then
 EXITAFTERANALYSIS=true
+elif [[ $1 = '-capture-null-dereferences' ]]
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -capture-null-dereferences"
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DCAPTURE_NULL_DEREFERENCES"
+elif [[ $1 = '-src-after-pp' ]]
+then
+SRCAFTERPP=true
 elif [[ $1 = '-assembly' ]]
 then
 ASSEMBLY=true
@@ -289,6 +398,13 @@ shift
 elif [[ $1 = '-mac' ]]
 then
 EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DMAC"
+elif [[ $1 = '-squeue' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DSQUEUE"
+elif [[ $1 = '-corepin' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DCOREPIN"
+SQUEUE=true
 elif [[ $1 = '-profile' ]]
 then
 PROFILEFLAG=true
@@ -296,9 +412,15 @@ EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -pg"
 elif [[ $1 = '-gcprofile' ]]
 then
 GCPROFILEFLAG=true
+elif [[ $1 = '-gcprofile_s' ]]
+then
+GCPROFILESFLAG=true
 elif [[ $1 = '-accurateprofile' ]]
 then
 ACCURATEPROFILEFLAG=true
+elif [[ $1 = '-profile_interrupt' ]]
+then
+PROFILEINTERRUPTFLAG=true
 elif [[ $1 = '-useio' ]]
 then
 USEIOFLAG=true
@@ -318,19 +440,20 @@ JAVAOPTS="$JAVAOPTS -multicore"
 elif [[ $1 = '-numcore' ]]
 then
 JAVAOPTS="$JAVAOPTS -numcore $2"
+TILERACORES="$2"
 if [[ "$2" -gt "1" ]]
 then
 TILERAN1COREFLAG=true
+if [[ "$2" -eq "56" ]]
+then
+TILERA56COREFLAG=true
+fi
 fi
 shift
 elif [[ $1 = '-numcore4gc' ]]
 then
 JAVAOPTS="$JAVAOPTS -numcore4gc $2"
 GCCORES="GC_$2"
-if [[ "$2" -eq "1" ]]
-then
-GC1COREFLAG=true
-fi
 shift
 elif [[ $1 = '-raw' ]]
 then
@@ -344,13 +467,13 @@ elif [[ $1 = '-tilera_zlinux' ]]
 then
 TILERAFLAG=true
 TILERAZLINUXFLAG=true
+elif [[ $1 = '-tilera_memprof' ]]
+then
+TILERAMEMPROFFLAG=true
 elif [[ $1 = '-tileraconfig' ]]
 then
 TILERACONFIG="$2"
 shift
-elif [[ $1 = '-cacheflush' ]]
-then
-CACHEFLUSHFLAG=true
 elif [[ $1 = '-rawconfig' ]]
 then
 RAWCONFIG="$2"
@@ -369,6 +492,13 @@ elif [[ $1 = '-multicoregc' ]]
 then
 MULTICOREGCFLAG=true
 JAVAOPTS="$JAVAOPTS -multicoregc"
+elif [[ $1 = '-pmc' ]]
+then
+PMCFLAG=true
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -pmc"
+elif [[ $1 = '-perfcount' ]]
+then
+PERFCOUNT=true
 elif [[ $1 = '-gcmem_local' ]]
 then
 GCMEMLOCALFLAG=true
@@ -381,6 +511,61 @@ GCMEMMIXEDFLAG=true
 elif [[ $1 = '-gcmem_global' ]]
 then
 GCMEMGLOBALFLAG=true
+elif [[ $1 = '-gccache_local' ]]
+then
+GCCACHELOCALFLAG=true
+elif [[ $1 = '-gccache_ran' ]]
+then
+GCCACHERANFLAG=true
+elif [[ $1 = '-gccontroller_near' ]]
+then
+GCCONTROLLERNEARFLAG=true
+elif [[ $1 = '-gccontroller_remote' ]]
+then
+GCCONTROLLERREMOTEFLAG=true
+elif [[ $1 = '-gcsmallpagesize' ]]
+then
+GCSMALLPAGESIZEFLAG=true
+elif [[ $1 = '-gcsmallpagesize2' ]]
+then
+GCSMALLPAGESIZEFLAG2=true
+elif [[ $1 = '-gclargepagesize' ]]
+then
+GCLARGEPAGESIZEFLAG=true
+elif [[ $1 = '-gclargepagesize2' ]]
+then
+GCLARGEPAGESIZE2FLAG=true
+elif [[ $1 = '-gclargesharedheap' ]]
+then
+GCLARGESHAREDHEAPFLAG=true
+elif [[ $1 = '-gclargesharedheap2' ]]
+then
+GCLARGESHAREDHEAPFLAG2=true
+elif [[ $1 = '-gccacheadapt' ]]
+then
+GCCACHEADAPTFLAG=true
+elif [[ $1 = '-gccacheadaptpolicy' ]]
+then
+GCCACHEADAPTPOLICYFLAG=true
+GCCACHEADAPTPOLICY="$2"
+shift
+elif [[ $1 = '-gccachesampling' ]]
+then
+GCCACHESAMPLINGFLAG=true
+elif [[ $1 = '-mgc' ]]
+then
+MGCFLAG=true
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -mgc"
+elif [[ $1 = '-mgcintel' ]]
+then
+MGCINTELFLAG=true
+elif [[ $1 = '-objectlockdebug' ]]
+then
+OBJECTLOCKDEBUGFLAG=true
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -objectlockdebug"
+elif [[ $1 = '-gctbldebug' ]]
+then
+GCTBLDEBUGFLAG=true
 elif [[ $1 = '-dmalloc' ]]
 then
 USEDMALLOC=true
@@ -401,6 +586,9 @@ JAVAOPTS="$JAVAOPTS -instructionfailures"
 elif [[ $1 = '-joptimize' ]]
 then
 JAVAOPTS="$JAVAOPTS -optimize"
+elif [[ $1 = '-noloop' ]]
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -noloop"
 elif [[ $1 = '-dcopts' ]]
 then
 JAVAOPTS="$JAVAOPTS -dcopts"
@@ -424,6 +612,80 @@ EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DPRECISE_GC -lpthread -DMLP"
 shift
 shift
 
+elif [[ $1 = '-ooodebug-disable-task-mem-pool' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DOOO_DISABLE_TASKMEMPOOL"
+
+elif [[ $1 = '-ssjava' ]]
+then
+SSJAVA=true
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -ssjava"
+
+elif [[ $1 = '-ssjavadebug' ]]
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -ssjavadebug"
+
+elif [[ $1 = '-mempool-detect-misuse' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DMEMPOOL_DETECT_MISUSE"
+
+elif [[ $1 = '-heapsize-mb' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DINITIALHEAPSIZE_MB=($2)"
+shift
+
+elif [[ $1 = '-nostalltr' ]]
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -nostalltr"
+
+elif [[ $1 = '-printlinenum' ]]
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -printlinenum"
+
+elif [[ $1 = '-rcr' ]]
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -rcr"
+RCR=true
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DRCR -I$ROBUSTROOT/Runtime/oooJava"
+
+elif [[ $1 = '-rcr_debug' ]]
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -rcr_debug"
+RCR_DEBUG=true
+
+elif [[ $1 = '-rcr_debug_verbose' ]]
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -rcr_debug_verbose"
+RCR_DEBUG_VERBOSE=true
+
+elif [[ $1 = '-debug-deque' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DDEBUG_DEQUE"
+
+elif [[ $1 = '-nolock' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DNOLOCK"
+
+elif [[ $1 = '-coreprof' ]]
+then
+COREPROF=true
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -coreprof"
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DCOREPROF -I$ROBUSTROOT/Runtime/coreprof"
+
+elif [[ $1 = '-coreprof-eventwords' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DCP_MAXEVENTWORDS=($2)"
+shift
+
+elif [[ $1 = '-coreprof-checkoverflow' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DCOREPROF_CHECKOVERFLOW"
+
+elif [[ $1 = '-coreprof-enable' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -D$2"
+shift
+
 elif [[ $1 = '-mlp' ]]
 then
 MLP_ON=true
@@ -513,6 +775,8 @@ done
 
 BUILDDIR="$CURDIR/$tmpbuilddirectory"
 
+BAMBOORUNTIME=$ROBUSTROOT/Runtime/bamboo
+
 cd $1
 cd $CURDIR
 shift
@@ -524,54 +788,98 @@ then
 JAVAOPTS="$JAVAOPTS -struct structfile"
 fi
 
+
+
+#########################
 # Setup class path
+#########################
+if $JNI
+  then
+  JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/classpath/ -classlibrary $ROBUSTROOT/classpath/vm/reference"
+
+elif $MGCINTELFLAG
+  then
+  JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/MGC/ -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/MGC/gnu/"
+
+elif $MGCFLAG
+  then
+  #base multicore gc files
+  JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/MGC/ -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/MGC/gnu/"
+
+elif $SSJAVA
+  then
+  JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/SSJava"  
 
-if $RECOVERFLAG
-then
-if $FASTCHECK
-then
-#fast transactions
-JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/FastCheck"
-else
-#base bristlecone files
-JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/Bristlecone"
-fi
 else
-if $DSMFLAG
-then
-#dsm stuff
-JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/JavaDSM"
-elif $STM
-then
-JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/JavaSTM"
-elif $THREADFLAG
-then
-#threading java stuff
-JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/JavaThread"
+  if $RECOVERFLAG
+    then
+    if $FASTCHECK
+      then
+      #fast transactions
+      JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/FastCheck"
+    else
+      #base bristlecone files
+      JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/Bristlecone"
+    fi
+
+  elif $DSMFLAG
+    then
+    #dsm stuff
+    JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/JavaDSM"
+
+  elif $STM
+    then
+    JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/JavaSTM"
+
+  elif $THREADFLAG
+    then
+    #threading java stuff
+    JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/JavaThread"
+
+  else 
+    #base java stuff
+    JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/Java"
+  fi
 fi
-#base java stuff
-JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/Java"
+
+# everyone gets this except ssjava!
+if ! $SSJAVA
+  then
+  JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/ -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/gnu/"
 fi
+#########################
+# end classpath
+#########################
+
+
 
 # Build bristlecone/java sources
 
 if $MULTICOREFLAG
-then
-if ! ${ROBUSTROOT}/ourjava -Xms50m -Xmx1500m $JAVAFORWARDOPTS -classpath $ROBUSTROOT/../cup/:$ROBUSTROOT Main.Main -classlibrary \
-$ROBUSTROOT/ClassLibrary/ -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/gnu/ \
--dir $BUILDDIR $JAVAOPTS $SRCFILES
-then exit $?
-fi
+  then
+  if ! ${ROBUSTROOT}/ourjava -Xms50m -Xmx1500m $JAVAFORWARDOPTS -classpath $ROBUSTROOT/../cup/:$ROBUSTROOT Main.Main \
+       -dir $BUILDDIR $JAVAOPTS $SRCFILES
+    then exit $?
+  fi
+
 else
-#if ! ${ROBUSTROOT}/ourjava -Xms5m -Xmx100m $JAVAFORWARDOPTS -classpath $ROBUSTROOT/../cup/:$ROBUSTROOT Main.Main -classlibrary \
-if ! $NOJAVA
-then
-if ! ${ROBUSTROOT}/ourjava -Xms50m -Xmx1500m $JAVAFORWARDOPTS -classpath $ROBUSTROOT/../cup/:$ROBUSTROOT Main.Main -classlibrary \
-$ROBUSTROOT/ClassLibrary/ -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/gnu/ -dir $BUILDDIR -precise \
-$JAVAOPTS $SRCFILES
-then exit $?
-fi
-fi
+
+  if $MGCINTELFLAG
+    then
+    if ! ${ROBUSTROOT}/ourjava -Xms50m -Xmx1500m $JAVAFORWARDOPTS -classpath $ROBUSTROOT/../cup/:$ROBUSTROOT Main.Main $JAVAOPTS \
+         -dir $BUILDDIR -precise $SRCFILES
+      then exit $?
+    fi
+
+  else
+    if ! $NOJAVA
+      then
+      if ! ${ROBUSTROOT}/ourjava -Xms50m -Xmx1500m $JAVAFORWARDOPTS -classpath $ROBUSTROOT/../cup/:$ROBUSTROOT Main.Main \
+          -dir $BUILDDIR -precise $JAVAOPTS $SRCFILES
+        then exit $?
+      fi
+    fi
+  fi
 fi
 
 if $EXITAFTERANALYSIS
@@ -628,11 +936,6 @@ rm ./*
 
 export RAWRGCCFLAGS="-DTASK -DMULTICORE -DRAW"
 
-if $CACHEFLUSHFLAG
-then # print path
-RAWRGCCFLAGS="${RAWRGCCFLAGS} -DCACHEFLUSH"
-fi
-
 if $RAWPATHFLAG
 then # print path
 RAWRGCCFLAGS="${RAWRGCCFLAGS} -DRAWPATH"
@@ -671,15 +974,17 @@ else
 MAKEFILE="$MAKEFILE.$RAWCONFIG"
 fi #useio version
 
-cp $ROBUSTROOT/Runtime/RAW/$MAKEFILE ./Makefile
+cp $BAMBOORUNTIME/RAW/$MAKEFILE ./Makefile
 cp ../Runtime/*.c ./
 cp ../Runtime/*.h ./
 cp ../Runtime/*.S ./
 cp ../Runtime/*.s ./
-cp ../Runtime/RAW/*.c ./
-cp ../Runtime/RAW/*.h ./
-cp ../Runtime/RAW/*.S ./
-cp ../Runtime/RAW/*.s ./
+cp $BAMBOORUNTIME/*.c ./
+cp $BAMBOORUNTIME/*.h ./
+cp $BAMBOORUNTIME/RAW/*.c ./
+cp $BAMBOORUNTIME/RAW/*.h ./
+cp $BAMBOORUNTIME/RAW/*.S ./
+cp $BAMBOORUNTIME/RAW/*.s ./
 cp ../$tmpbuilddirectory/*.c ./
 cp ../$tmpbuilddirectory/*.h ./
 
@@ -691,27 +996,46 @@ TILERADIR="$CURDIR/tilera"
 if $TILERABMEFLAG
 then # TILERABMEFLAG
 TILERA_INDIR="BME"
-MAKEFILE="Makefile.tilera.$TILERACONFIG"
-SIMHVC="sim.hvc.$TILERACONFIG"
-PCIHVC="pci.hvc.$TILERACONFIG"
-if $GC1COREFLAG 
-then # 1-core gc
-  if $TILERAN1COREFLAG
-  then # not only with 1 core
-       PCIHVC="$PCIHVC.1gc"
-  fi
+MAKEFILE="Makefile.tilera.$TILERACORES"
+#SIMHVC="sim.hvc.$TILERACONFIG"
+PCIHVC="pci.hvc.$TILERACORES"
+if $TILERA56COREFLAG
+then
+  PCIHVC="$PCIHVC.56"
 fi
 elif $TILERAZLINUXFLAG
 then # TILERAZLINUXFLAG
 TILERA_INDIR="ZLinux"
 MAKEFILE="Makefile.tilera.$TILERACONFIG"
 fi
+
 mkdir $TILERADIR
 cd $TILERADIR
 make clean
 rm ./*
 
+if $MGCFLAG
+then
+export TILERACFLAGS="-DMULTICORE -DCLOSE_PRINT -DTILERA"
+else
 export TILERACFLAGS="-DTASK -DMULTICORE -DCLOSE_PRINT -DTILERA"
+fi
+
+if $GCTBLDEBUGFLAG
+then
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_TBL_DEBUG"
+fi
+
+if $OBJECTLOCKDEBUGFLAG
+then
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DOBJECT_LOCK_DEBUG"
+fi
+
+if $TILERAMEMPROFFLAG
+then # not only with 1 core
+  PCIHVC="$PCIHVC.memprof"
+  TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DBAMBOO_MEMPROF"
+fi
 
 if $TILERABMEFLAG
 then # TILERABMEFLAG
@@ -721,11 +1045,6 @@ then # TILERAZLINUXFLAG
 TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DTILERA_ZLINUX"
 fi
 
-if $CACHEFLUSHFLAG
-then # print path
-TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DCACHEFLUSH"
-fi
-
 if $RAWPATHFLAG
 then # print path
 TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DRAWPATH"
@@ -746,6 +1065,11 @@ then # accurateprofile version
 TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DACCURATEPROFILE"
 fi
 
+if $PROFILEINTERRUPTFLAG
+then # profile_interrupt version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DPROFILE_INTERRUPT"
+fi
+
 if $USEIOFLAG
 then # useio version
 TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DUSEIO"
@@ -756,16 +1080,36 @@ then #INTERRUPT version
 TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DINTERRUPT"
 fi #INTERRUPT version
 
+if $MGCFLAG
+then #MGCFLAG
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DMGC -DMGC_SPEC"
+fi
+
 if $MULTICOREGCFLAG
 then #MULTICOREGC version
 TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DMULTICORE_GC -D${GCCORES}"
 fi
 
+if $PMCFLAG
+then #MULTICOREGC version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DPMC_GC -D${GCCORES}"
+fi
+
+if $PERFCOUNT
+then #MULTICOREGC version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DPERFCOUNT"
+fi
+
 if $GCPROFILEFLAG
 then # GC_PROFILE version
 TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_PROFILE"
 fi
 
+if $GCPROFILESFLAG
+then # GC_PROFILE_S version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_PROFILE_S"
+fi
+
 if $GCMEMLOCALFLAG
 then # SMEMLOCAL version
 TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DSMEML"
@@ -786,40 +1130,116 @@ then # SMEMGLOBAL version
 TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DSMEMG"
 fi
 
+if $GCCACHELOCALFLAG
+then # CACHE_LOCAL version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DCACHE_LOCAL"
+fi
+
+if $GCCACHERANFLAG
+then # CACHE_RAN version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DCACHE_RAN"
+fi
+
+if $GCCONTROLLERNEARFLAG
+then # CONTROLLER_NEAR version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DCONTROLLER_NEAR"
+fi
+
+if $GCCONTROLLERREMOTEFLAG
+then # CONTROLLER_REMOTE version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DCONTROLLER_REMOTE"
+fi
+
+if $GCSMALLPAGESIZEFLAG
+then # GC_SMALLPAGESIZE version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_SMALLPAGESIZE"
+fi
+
+if $GCLARGEPAGESIZEFLAG
+then # GC_LARGEPAGESIZE version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_LARGEPAGESIZE"
+fi
+
+if $GCLARGEPAGESIZE2FLAG
+then # GC_LARGEPAGESIZE2 version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_LARGEPAGESIZE2"
+fi
+
+if $GCLARGESHAREDHEAPFLAG
+then # GC_LARGESHAREDHEAP version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_LARGESHAREDHEAP"
+fi
+
+if $GCSMALLPAGESIZEFLAG2
+then # GC_SMALLPAGESIZE2 version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_SMALLPAGESIZE2"
+fi
+
+if $GCLARGESHAREDHEAPFLAG2
+then # GC_LARGESHAREDHEAP2 version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_LARGESHAREDHEAP2"
+fi
+
+if $GCCACHEADAPTFLAG
+then # GC_CACHE_ADAPT version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_CACHE_ADAPT"
+fi
+
+if $GCCACHEADAPTPOLICYFLAG
+then # GC_CACHE_ADAPT version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_CACHE_ADAPT_POLICY${GCCACHEADAPTPOLICY}"
+fi
+
+if $GCCACHESAMPLINGFLAG
+then # GC_CACHE_ADAPT version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_CACHE_SAMPLING"
+fi
+
+if $PMCFLAG
+then
+cp $ROBUSTROOT/Tilera/Runtime/PMC/$MAKEFILE ./Makefile
+elif $MGCFLAG
+then
+cp $ROBUSTROOT/Tilera/Runtime/MGC/$MAKEFILE ./Makefile
+else
 cp $ROBUSTROOT/Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/$MAKEFILE ./Makefile
+fi
 if $TILERABMEFLAG
 then # TILERABMEFLAG
-cp $ROBUSTROOT/Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/$SIMHVC ./sim.hvc
+#cp $ROBUSTROOT/Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/$SIMHVC ./sim.hvc
 cp $ROBUSTROOT/Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/$PCIHVC ./pci.hvc
+if $TILERA56COREFLAG
+then
+cp $ROBUSTROOT/Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/bamboo-vmlinux-pci.hvc.56 ./bamboo-vmlinux-pci.hvc.56
+else
 cp $ROBUSTROOT/Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/bamboo-vmlinux-pci.hvc ./bamboo-vmlinux-pci.hvc
 fi
-cp ../Runtime/multicoretask.c ./
-cp ../Runtime/multicoreruntime.c ./
+fi
 cp ../Runtime/Queue.c ./
 cp ../Runtime/file.c ./
 cp ../Runtime/math.c ./
+if [ !$MGCFLAG ]
+then
 cp ../Runtime/object.c ./
+fi
 cp ../Runtime/GenericHashtable.c ./
 cp ../Runtime/SimpleHash.c ./
-cp ../Runtime/GCSharedHash.c ./
 cp ../Runtime/ObjectHash.c ./
 cp ../Runtime/socket.c ./
 cp ../Runtime/mem.c ./
-cp ../Runtime/multicoregarbage.c ./
-cp ../Runtime/MGCHash.c ./
 cp ../Runtime/GenericHashtable.h ./
 cp ../Runtime/mem.h ./
-cp ../Runtime/multicoreruntime.h ./
+if [ !$MGCFLAG ]
+then
 cp ../Runtime/object.h ./
+fi
 cp ../Runtime/ObjectHash.h ./
 cp ../Runtime/Queue.h ./
 cp ../Runtime/runtime.h ./
 cp ../Runtime/SimpleHash.h ./
-cp ../Runtime/GCSharedHash.h ./
-cp ../Runtime/multicoregc.h ./
-cp ../Runtime/multicoregarbage.h ./
-cp ../Runtime/multicorehelper.h ./
-cp ../Runtime/MGCHash.h ./
+cp ../Runtime/objtypes.h ./
+cp $BAMBOORUNTIME/*.c ./
+cp $BAMBOORUNTIME/*.h ./
 cp ../Tilera/Runtime/*.c ./
 cp ../Tilera/Runtime/*.h ./
 cp ../Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/*.c ./
@@ -828,10 +1248,21 @@ if $TILERAZLINUXFLAG
 then # TILERAZLINUXFLAG
 cp ../Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/*.S ./
 fi
+#if $TILERAMEMPROFFLAG
+#then # TILERAMEMPROFFLAG
+cp ../Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/linux_client.c ./
+#fi
+if $MGCFLAG
+then
+cp ../Tilera/Runtime/MGC/*.c ./
+cp ../Tilera/Runtime/MGC/*.h ./
+fi
 cp ../Tilera/lib/* ./
 cp ../$tmpbuilddirectory/*.c ./
 cp ../$tmpbuilddirectory/*.h ./
 
+echo $TILERA_CFLAGS
+
 make
 
 else #!RAWFLAG && !TILERABMEFLAG  && ! TILERAZLINUXFLAG
@@ -842,7 +1273,8 @@ INCLUDES="$INCLUDES -I$ROBUSTROOT/Runtime -I. -IRuntime/include \
 
 if $MULTICOREFLAG
 then
-RUNTIMEFILE="$ROBUSTROOT/Runtime/multicoreruntime.c $ROBUSTROOT/Runtime/multicoretask.c"
+RUNTIMEFILE="$BAMBOORUNTIME/multicoreruntime.c $BAMBOORUNTIME/multicoretask.c"
+INCLUDES="$INCLUDES -I$BAMBOORUNTIME"
 else
 RUNTIMEFILE="$ROBUSTROOT/Runtime/runtime.c $ROBUSTROOT/Runtime/task.c"
 fi
@@ -852,9 +1284,15 @@ $ROBUSTROOT/Runtime/file.c $ROBUSTROOT/Runtime/Queue.c \
 $ROBUSTROOT/Runtime/SimpleHash.c $ROBUSTROOT/Runtime/option.c \
 $ROBUSTROOT/Runtime/ObjectHash.c \
 $ROBUSTROOT/Runtime/garbage.c $ROBUSTROOT/Runtime/socket.c \
+$ROBUSTROOT/Runtime/taskgarbage.c $ROBUSTROOT/Runtime/oojgarbage.c \
 $ROBUSTROOT/Runtime/math.c \
 $ROBUSTROOT/Runtime/GenericHashtable.c $ROBUSTROOT/Runtime/object.c"
 
+if $JNI
+then
+FILES="$FILES $ROBUSTROOT/Runtime/jni/jni.c $ROBUSTROOT/Runtime/jni/jni-stuff.c"
+fi
+
 if $NUMA
 then
 FILES="$FILES $ROBUSTROOT/Runtime/affinity.c"
@@ -908,11 +1346,25 @@ then
 FILES="$FILES $ROBUSTROOT/Runtime/localobjects.c"
 fi
 
+if $COREPROF
+then
+FILES="$FILES $ROBUSTROOT/Runtime/coreprof/coreprof.c"
+fi
+
+if $RCR
+then
+FILES="$FILES $tmpbuilddirectory/RuntimeConflictResolver.c $ROBUSTROOT/Runtime/oooJava/hashRCR.c $ROBUSTROOT/Runtime/oooJava/Queue_RCR.c $ROBUSTROOT/Runtime/oooJava/hashStructure.c $ROBUSTROOT/Runtime/oooJava/trqueue.c $ROBUSTROOT/Runtime/oooJava/rcr_runtime.c"
+fi
+
 if $MLP_ON
 then
 FILES="$FILES $ROBUSTROOT/Runtime/mlp_runtime.c"
 FILES="$FILES $ROBUSTROOT/Runtime/psemaphore.c"
 FILES="$FILES $ROBUSTROOT/Runtime/workschedule.c"
+if ! $SQUEUE
+then
+FILES="$FILES $ROBUSTROOT/Runtime/deque.c"
+fi
 fi
 
 if $RECOVERFLAG
@@ -956,6 +1408,9 @@ then
 EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -ldmalloc -DDMALLOC"
 fi
 
+echo Compiling C...
+echo EXTRAOPTIONS=$EXTRAOPTIONS
+
 if $ASSEMBLY
 then
 gcc -S $INCLUDES $EXTRAOPTIONS -DPRECISE_GC \
@@ -964,13 +1419,21 @@ fi
 
 if $MULTICOREFLAG
 then
-gcc $INCLUDES $EXTRAOPTIONS \
-$tmpbuilddirectory/methods.c $FILES -lm -o $MAINFILE.bin
+NONMULTICOREOPTS=
 else
-gcc $INCLUDES $EXTRAOPTIONS -DPRECISE_GC \
-$tmpbuilddirectory/methods.c $FILES -lm -o $MAINFILE.bin
+NONMULTICOREOPTS=-DPRECISE_GC
 fi
 
+if $SRCAFTERPP
+then
+gcc -E $INCLUDES $EXTRAOPTIONS $NONMULTICOREOPTS \
+$tmpbuilddirectory/methods.c $FILES > tmp.c
+fi
+
+gcc $INCLUDES $EXTRAOPTIONS $NONMULTICOREOPTS \
+$tmpbuilddirectory/methods.c $FILES -lm -o $MAINFILE.bin
+
+
 fi #!RAWFLAG