change the debug mode for capturing null dereference to a global compilar option
[IRC.git] / Robust / src / buildscript
index 4b9ea31dce62492682ff273a6d943a8dabec7f48..e6fbc1d5172275d9597e3084a70c202e0e3e054c 100755 (executable)
@@ -17,11 +17,22 @@ echo "-numa numa aware"
 echo "-eventmonitor turn on transaction event trace recording"
 echo
 echo OOOJava options
-echo -coreprof turn on profiling API
-echo -coreprof-checkoverflow ONLY use for debugging event overflow
+echo -coreprof, turn on profiling API
+echo -coreprof-eventwords NUM, space in words/thread for coreprof events
+echo -coreprof-checkoverflow, ONLY use for debugging event overflow
+echo -coreprof-enable EVENTNAME, only enable desired events to reduce overhead
+echo   EVENTNAME can be: cpe_main, cpe_runmalloc, cpe_runfree, cpe_poolalloc, cpe_count_poolalloc, cpe_count_poolreuse, cpe_workschedgrab, cpe_taskdispatch, cpe_preparememq, cpe_taskexecute, cpe_taskretire, cpe_taskstallvar, cpe_taskstallmem 
 echo "-ooojava <numberofcores> <maxseseage>"
 echo -ooodebug general OOOJava debugging messages
+echo -ooodebug-disable-task-mem-pool this is a tricky module, disable for simpler runtime
+echo -mempool-detect-misuse turn on to find code misusing pool-allocated records
 echo -rcr turn on runtime conflict resolver
+echo -rcr_debug Shows weakly connected heaproots and which allocation sites were considered for traversal
+echo -rcr_debug_verbose in addition to above, also prints out effects passed in, internal representation of effects, and internal representation of reach graph
+echo -squeue use single queue
+echo -corepin use core pinning
+echo -nostalltr turn off RCR traversers that only handle conflicts between task and stallsite
+echo -nolock turn off synchronization lock
 echo
 echo Disjoint Reachability Analysis options
 echo -disjoint enable analysis
@@ -51,6 +62,9 @@ echo -dsmcaching -enable caching in dsm runtime
 echo
 echo BAMBOO Multicore options
 echo -scheduling do task scheduling
+echo "-distributioninfo  execute to collect distribution info for simulated annealing in multi-core version"
+echo "-disall  execute to collect whole distribution"
+echo "-disstart specify the start number of distribution information collection"
 echo -multicore generate multi-core version binary
 echo "-numcore set the number of cores (should be used together with -multicore), defaultly set as 1"
 echo "-cacheflush enable cache flush in raw version binary (should be used togethere with -raw)"
@@ -64,6 +78,12 @@ echo "-tilera_zlinux generate tilera version binary for Zero-Overhead Linux with
 echo "-tileraconfig config tilera simulator/pci as nxm (should be used together with -tilera)"
 echo "-raw generate raw version binary (should be used together with -multicore)"
 echo "-rawconfig config raw simulator as 4xn (should be used together with -raw)"
+echo "-tilera_memprof build the memprof version (should be used together with -tilera_xx) "
+echo -accurateprofile build with accurate profile information including pre/post task processing info
+echo -profile_interrupt build with profile information of interrupts
+echo "-useio use standard io to output profiling data (should be used together with -raw and -profile), it only works with single core version"
+echo
+echo Multicore GC options
 echo -multicoregc generate multi-core binary with garbage collection
 echo "-numcore4gc set the number of cores for gc (should be used together with -multicoregc), defaultly set as 0"
 echo "-gcmem_local set the gc shared memory allocation strategy as local (should be used together with -multicoregc)"
@@ -77,13 +97,17 @@ echo "-gccontroller_remote set the gc shared memory to use a remote controller f
 echo "-gcsmallpagesize(2) set the gc shared memory to use small page size (should be used together with -multicoregc)"
 echo "-gclargepagesize set the gc shared memory to use large page size (should be used together with -multicoregc)"
 echo "-gclargesharedheap(2) set the gc shared memory as large (should be used together with -multicoregc)"
+echo "-gccacheadapt setup as cacheadaptable mode (should be used together with -multicoregc)"
 echo -gcprofile build with gcprofile options
-echo "-tilera_memprof build the memprof version (should be used together with -tilera_xx) "
-echo -accurateprofile build with accurate profile information including pre/post task processing info
-echo -profile_interrupt build with profile information of interrupts
-echo "-useio use standard io to output profiling data (should be used together with -raw and -profile), it only works with single core version"
+echo -mgc generate Multicore GC binary without task stuff
+echo -objectlockdebug generate OBJECT_LOCK_DEBUG code
+echo -gctbldebug generate GC_TBL_DEBUG code
+echo
+echo SSJava options
+echo -ssjava enables SSJava
 echo
 echo Other options
+echo -jni enable jni
 echo -abcclose turnoff array boundary checks
 echo -builddir setup different build directory
 echo -robustroot set up the ROBUSTROOT to directory other than default one
@@ -121,17 +145,19 @@ echo -instructionfailures inject code for instructionfailures
 echo -profile build with profile options
 echo "-enable-assertions execute assert statements during compilation"
 echo -justanalyze exit after compiler analyses complete
-echo "-distributioninfo  execute to collect distribution info for simulated annealing in multi-core version"
-echo "-disall  execute to collect whole distribution"
-echo "-disstart specify the start number of distribution information collection"
 echo -assembly generate assembly
 echo -recovery compile recovery code
 echo -dsmtask support work and task class library
 echo -recoverystats print out recovery record 
+echo -src-after-pp prints source code after preprocessor to tmp.c
+echo -capture-null-dereferences generates code to warn before derefencing null
+echo -printlinenum print out line numbers in generated C codes
 echo -help help
 }
 
 tmpbuilddirectory="tmpbuilddirectory"
+JNI=false
+SRCAFTERPP=false;
 COREPROF=false;
 NUMA=false;
 SANDBOX=false;
@@ -142,6 +168,7 @@ STMRUNTIME=$ROBUSTROOT/Runtime/STM/
 DSMRECOVERYRUNTIME=$ROBUSTROOT/Runtime/DSTM/interface_recovery/
 REPAIRROOT=~/research/Repair/RepairCompiler/
 CURDIR=`pwd`
+SQUEUE=false
 DSMFLAG=false
 DSMRECOVERY=false
 FASTMEMCPY=false
@@ -154,6 +181,8 @@ CHECKFLAG=false
 RECOVERFLAG=false
 MLP_ON=false
 RCR=false
+RCR_DEBUG=false
+RCR_DEBUG_VERBOSE=false
 MLPDEBUG=false
 MULTICOREFLAG=false
 RAWFLAG=false
@@ -162,6 +191,7 @@ TILERABMEFLAG=false
 TILERAZLINUXFLAG=false
 TILERAMEMPROFFLAG=false
 TILERACONFIG=''
+TILERACORES=''
 CACHEFLUSHFLAG=false
 RAWCONFIG=''
 DEBUGFLAG=false
@@ -185,9 +215,18 @@ GCCONTROLLERNEARFLAG=false;
 GCCONTROLLERREMOTEFLAG=false;
 GCSMALLPAGESIZEFLAG=false;
 GCLARGEPAGESIZEFLAG=false;
+GCLARGEPAGESIZE2FLAG=false;
 GCLARGESHAREDHEAPFLAG=false;
 GCSMALLPAGESIZEFLAG2=false;
 GCLARGESHAREDHEAPFLAG2=false;
+GCCACHEADAPTFLAG=false
+GCCACHEADAPTPOLICYFLAG=false
+GCCACHEADAPTPOLICY=''
+GCCACHESAMPLINGFLAG=false
+MGCFLAG=false
+MGCINTELFLAG=false
+OBJECTLOCKDEBUGFLAG=false
+GCTBLDEBUGFLAG=false
 USEDMALLOC=false
 THREADFLAG=false
 FASTCHECK=false
@@ -201,7 +240,6 @@ OPTIONALFLAG=false
 EXITAFTERANALYSIS=false
 ASSEMBLY=false
 GCCORES=''
-GC1COREFLAG=false
 TILERAN1COREFLAG=false
 TILERA56COREFLAG=false
 
@@ -217,9 +255,21 @@ if [[ $1 = '-help' ]]
 then
 printhelp
 exit
+elif [[ $1 = '-jni' ]]
+then
+JNI=true
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -jni"
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DJNI -I$ROBUSTROOT/Runtime/jni"
 elif [[ $1 = '-justanalyze' ]]
 then
 EXITAFTERANALYSIS=true
+elif [[ $1 = '-capture-null-dereferences' ]]
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -capture-null-dereferences"
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DCAPTURE_NULL_DEREFERENCES"
+elif [[ $1 = '-src-after-pp' ]]
+then
+SRCAFTERPP=true
 elif [[ $1 = '-assembly' ]]
 then
 ASSEMBLY=true
@@ -342,6 +392,13 @@ shift
 elif [[ $1 = '-mac' ]]
 then
 EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DMAC"
+elif [[ $1 = '-squeue' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DSQUEUE"
+elif [[ $1 = '-corepin' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DCOREPIN"
+SQUEUE=true
 elif [[ $1 = '-profile' ]]
 then
 PROFILEFLAG=true
@@ -377,6 +434,7 @@ JAVAOPTS="$JAVAOPTS -multicore"
 elif [[ $1 = '-numcore' ]]
 then
 JAVAOPTS="$JAVAOPTS -numcore $2"
+TILERACORES="$2"
 if [[ "$2" -gt "1" ]]
 then
 TILERAN1COREFLAG=true
@@ -390,10 +448,6 @@ elif [[ $1 = '-numcore4gc' ]]
 then
 JAVAOPTS="$JAVAOPTS -numcore4gc $2"
 GCCORES="GC_$2"
-if [[ "$2" -eq "1" ]]
-then
-GC1COREFLAG=true
-fi
 shift
 elif [[ $1 = '-raw' ]]
 then
@@ -468,12 +522,40 @@ GCSMALLPAGESIZEFLAG2=true
 elif [[ $1 = '-gclargepagesize' ]]
 then
 GCLARGEPAGESIZEFLAG=true
+elif [[ $1 = '-gclargepagesize2' ]]
+then
+GCLARGEPAGESIZE2FLAG=true
 elif [[ $1 = '-gclargesharedheap' ]]
 then
 GCLARGESHAREDHEAPFLAG=true
 elif [[ $1 = '-gclargesharedheap2' ]]
 then
 GCLARGESHAREDHEAPFLAG2=true
+elif [[ $1 = '-gccacheadapt' ]]
+then
+GCCACHEADAPTFLAG=true
+elif [[ $1 = '-gccacheadaptpolicy' ]]
+then
+GCCACHEADAPTPOLICYFLAG=true
+GCCACHEADAPTPOLICY="$2"
+shift
+elif [[ $1 = '-gccachesampling' ]]
+then
+GCCACHESAMPLINGFLAG=true
+elif [[ $1 = '-mgc' ]]
+then
+MGCFLAG=true
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -mgc"
+elif [[ $1 = '-mgcintel' ]]
+then
+MGCINTELFLAG=true
+elif [[ $1 = '-objectlockdebug' ]]
+then
+OBJECTLOCKDEBUGFLAG=true
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -objectlockdebug"
+elif [[ $1 = '-gctbldebug' ]]
+then
+GCTBLDEBUGFLAG=true
 elif [[ $1 = '-dmalloc' ]]
 then
 USEDMALLOC=true
@@ -520,17 +602,55 @@ EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DPRECISE_GC -lpthread -DMLP"
 shift
 shift
 
+elif [[ $1 = '-ooodebug-disable-task-mem-pool' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DOOO_DISABLE_TASKMEMPOOL"
+
+elif [[ $1 = '-ssjava' ]]
+then
+SSJAVA=true
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -ssjava"
+
+elif [[ $1 = '-mempool-detect-misuse' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DMEMPOOL_DETECT_MISUSE"
+
 elif [[ $1 = '-heapsize-mb' ]]
 then
 EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DINITIALHEAPSIZE_MB=($2)"
 shift
 
+elif [[ $1 = '-nostalltr' ]]
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -nostalltr"
+
+elif [[ $1 = '-printlinenum' ]]
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -printlinenum"
+
 elif [[ $1 = '-rcr' ]]
 then
 JAVAOPTS="$JAVAOPTS -rcr"
 RCR=true
-EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -I$ROBUSTROOT/Runtime/oooJava"
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DRCR -I$ROBUSTROOT/Runtime/oooJava"
 
+elif [[ $1 = '-rcr_debug' ]]
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -rcr_debug"
+RCR_DEBUG=true
+
+elif [[ $1 = '-rcr_debug_verbose' ]]
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -rcr_debug_verbose"
+RCR_DEBUG_VERBOSE=true
+
+elif [[ $1 = '-debug-deque' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DDEBUG_DEQUE"
+
+elif [[ $1 = '-nolock' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DNOLOCK"
 
 elif [[ $1 = '-coreprof' ]]
 then
@@ -538,10 +658,20 @@ COREPROF=true
 JAVAOPTS="$JAVAOPTS -coreprof"
 EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DCOREPROF -I$ROBUSTROOT/Runtime/coreprof"
 
+elif [[ $1 = '-coreprof-eventwords' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DCP_MAXEVENTWORDS=($2)"
+shift
+
 elif [[ $1 = '-coreprof-checkoverflow' ]]
 then
 EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -DCOREPROF_CHECKOVERFLOW"
 
+elif [[ $1 = '-coreprof-enable' ]]
+then
+EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -D$2"
+shift
+
 elif [[ $1 = '-mlp' ]]
 then
 MLP_ON=true
@@ -631,6 +761,8 @@ done
 
 BUILDDIR="$CURDIR/$tmpbuilddirectory"
 
+BAMBOORUNTIME=$ROBUSTROOT/Runtime/bamboo
+
 cd $1
 cd $CURDIR
 shift
@@ -643,7 +775,20 @@ JAVAOPTS="$JAVAOPTS -struct structfile"
 fi
 
 # Setup class path
-
+if $JNI
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/classpath/ -classlibrary $ROBUSTROOT/classpath/vm/reference"
+elif $MGCINTELFLAG
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/MGC/ -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/MGC/gnu/"
+elif $MGCFLAG
+then
+#base multicore gc files
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/MGC/ -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/MGC/gnu/"
+elif $SSJAVA
+then
+JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/SSJava"
+else
 if $RECOVERFLAG
 then
 if $FASTCHECK
@@ -654,8 +799,7 @@ else
 #base bristlecone files
 JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/Bristlecone"
 fi
-else
-if $DSMFLAG
+elif $DSMFLAG
 then
 #dsm stuff
 JAVAOPTS="$JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/JavaDSM"
@@ -675,13 +819,27 @@ fi
 
 if $MULTICOREFLAG
 then
-if ! ${ROBUSTROOT}/ourjava -Xms50m -Xmx1500m $JAVAFORWARDOPTS -classpath $ROBUSTROOT/../cup/:$ROBUSTROOT Main.Main -classlibrary \
-$ROBUSTROOT/ClassLibrary/ -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/gnu/ \
--dir $BUILDDIR $JAVAOPTS $SRCFILES
+if ! ${ROBUSTROOT}/ourjava -Xms50m -Xmx1500m $JAVAFORWARDOPTS -classpath $ROBUSTROOT/../cup/:$ROBUSTROOT Main.Main \
+-dir $BUILDDIR $JAVAOPTS -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/ \
+-classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/gnu/ $SRCFILES
+then exit $?
+fi
+elif $SSJAVA
+then
+if ! ${ROBUSTROOT}/ourjava -Xms50m -Xmx1500m $JAVAFORWARDOPTS -classpath $ROBUSTROOT/../cup/:$ROBUSTROOT Main.Main -dir $BUILDDIR -precise \
+$JAVAOPTS $SRCFILES
 then exit $?
 fi
 else
 #if ! ${ROBUSTROOT}/ourjava -Xms5m -Xmx100m $JAVAFORWARDOPTS -classpath $ROBUSTROOT/../cup/:$ROBUSTROOT Main.Main -classlibrary \
+if $MGCINTELFLAG
+then
+if ! ${ROBUSTROOT}/ourjava -Xms50m -Xmx1500m $JAVAFORWARDOPTS -classpath $ROBUSTROOT/../cup/:$ROBUSTROOT Main.Main $JAVAOPTS -classlibrary \
+$ROBUSTROOT/ClassLibrary/ -classlibrary $ROBUSTROOT/ClassLibrary/gnu/ -dir $BUILDDIR -precise \
+$SRCFILES
+then exit $?
+fi
+else
 if ! $NOJAVA
 then
 if ! ${ROBUSTROOT}/ourjava -Xms50m -Xmx1500m $JAVAFORWARDOPTS -classpath $ROBUSTROOT/../cup/:$ROBUSTROOT Main.Main -classlibrary \
@@ -691,6 +849,7 @@ then exit $?
 fi
 fi
 fi
+fi
 
 if $EXITAFTERANALYSIS
 then
@@ -789,15 +948,17 @@ else
 MAKEFILE="$MAKEFILE.$RAWCONFIG"
 fi #useio version
 
-cp $ROBUSTROOT/Runtime/RAW/$MAKEFILE ./Makefile
+cp $BAMBOORUNTIME/RAW/$MAKEFILE ./Makefile
 cp ../Runtime/*.c ./
 cp ../Runtime/*.h ./
 cp ../Runtime/*.S ./
 cp ../Runtime/*.s ./
-cp ../Runtime/RAW/*.c ./
-cp ../Runtime/RAW/*.h ./
-cp ../Runtime/RAW/*.S ./
-cp ../Runtime/RAW/*.s ./
+cp $BAMBOORUNTIME/*.c ./
+cp $BAMBOORUNTIME/*.h ./
+cp $BAMBOORUNTIME/RAW/*.c ./
+cp $BAMBOORUNTIME/RAW/*.h ./
+cp $BAMBOORUNTIME/RAW/*.S ./
+cp $BAMBOORUNTIME/RAW/*.s ./
 cp ../$tmpbuilddirectory/*.c ./
 cp ../$tmpbuilddirectory/*.h ./
 
@@ -809,16 +970,9 @@ TILERADIR="$CURDIR/tilera"
 if $TILERABMEFLAG
 then # TILERABMEFLAG
 TILERA_INDIR="BME"
-MAKEFILE="Makefile.tilera.$TILERACONFIG"
-SIMHVC="sim.hvc.$TILERACONFIG"
-PCIHVC="pci.hvc.$TILERACONFIG"
-if $GC1COREFLAG 
-then # 1-core gc
-  if $TILERAN1COREFLAG
-  then # not only with 1 core
-       PCIHVC="$PCIHVC.1gc"
-  fi
-fi
+MAKEFILE="Makefile.tilera.$TILERACORES"
+#SIMHVC="sim.hvc.$TILERACONFIG"
+PCIHVC="pci.hvc.$TILERACORES"
 if $TILERA56COREFLAG
 then
   PCIHVC="$PCIHVC.56"
@@ -834,7 +988,22 @@ cd $TILERADIR
 make clean
 rm ./*
 
+if $MGCFLAG
+then
+export TILERACFLAGS="-DMULTICORE -DCLOSE_PRINT -DTILERA"
+else
 export TILERACFLAGS="-DTASK -DMULTICORE -DCLOSE_PRINT -DTILERA"
+fi
+
+if $GCTBLDEBUGFLAG
+then
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_TBL_DEBUG"
+fi
+
+if $OBJECTLOCKDEBUGFLAG
+then
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DOBJECT_LOCK_DEBUG"
+fi
 
 if $TILERAMEMPROFFLAG
 then # not only with 1 core
@@ -890,6 +1059,11 @@ then #INTERRUPT version
 TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DINTERRUPT"
 fi #INTERRUPT version
 
+if $MGCFLAG
+then #MGCFLAG
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DMGC -DMGC_SPEC"
+fi
+
 if $MULTICOREGCFLAG
 then #MULTICOREGC version
 TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DMULTICORE_GC -D${GCCORES}"
@@ -955,6 +1129,11 @@ then # GC_LARGEPAGESIZE version
 TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_LARGEPAGESIZE"
 fi
 
+if $GCLARGEPAGESIZE2FLAG
+then # GC_LARGEPAGESIZE2 version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_LARGEPAGESIZE2"
+fi
+
 if $GCLARGESHAREDHEAPFLAG
 then # GC_LARGESHAREDHEAP version
 TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_LARGESHAREDHEAP"
@@ -970,11 +1149,30 @@ then # GC_LARGESHAREDHEAP2 version
 TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_LARGESHAREDHEAP2"
 fi
 
+if $GCCACHEADAPTFLAG
+then # GC_CACHE_ADAPT version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_CACHE_ADAPT"
+fi
+
+if $GCCACHEADAPTPOLICYFLAG
+then # GC_CACHE_ADAPT version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_CACHE_ADAPT_POLICY${GCCACHEADAPTPOLICY}"
+fi
+
+if $GCCACHESAMPLINGFLAG
+then # GC_CACHE_ADAPT version
+TILERACFLAGS="${TILERACFLAGS} -DGC_CACHE_SAMPLING"
+fi
 
+if $MGCFLAG
+then
+cp $ROBUSTROOT/Tilera/Runtime/MGC/$MAKEFILE ./Makefile
+else
 cp $ROBUSTROOT/Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/$MAKEFILE ./Makefile
+fi
 if $TILERABMEFLAG
 then # TILERABMEFLAG
-cp $ROBUSTROOT/Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/$SIMHVC ./sim.hvc
+#cp $ROBUSTROOT/Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/$SIMHVC ./sim.hvc
 cp $ROBUSTROOT/Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/$PCIHVC ./pci.hvc
 if $TILERA56COREFLAG
 then
@@ -983,33 +1181,42 @@ else
 cp $ROBUSTROOT/Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/bamboo-vmlinux-pci.hvc ./bamboo-vmlinux-pci.hvc
 fi
 fi
-cp ../Runtime/multicoretask.c ./
-cp ../Runtime/multicoreruntime.c ./
 cp ../Runtime/Queue.c ./
 cp ../Runtime/file.c ./
 cp ../Runtime/math.c ./
+if [ !$MGCFLAG ]
+then
 cp ../Runtime/object.c ./
+fi
 cp ../Runtime/GenericHashtable.c ./
 cp ../Runtime/SimpleHash.c ./
-cp ../Runtime/GCSharedHash.c ./
 cp ../Runtime/ObjectHash.c ./
 cp ../Runtime/socket.c ./
 cp ../Runtime/mem.c ./
-cp ../Runtime/multicoregarbage.c ./
-cp ../Runtime/MGCHash.c ./
 cp ../Runtime/GenericHashtable.h ./
 cp ../Runtime/mem.h ./
-cp ../Runtime/multicoreruntime.h ./
+if [ !$MGCFLAG ]
+then
 cp ../Runtime/object.h ./
+fi
 cp ../Runtime/ObjectHash.h ./
 cp ../Runtime/Queue.h ./
 cp ../Runtime/runtime.h ./
 cp ../Runtime/SimpleHash.h ./
-cp ../Runtime/GCSharedHash.h ./
-cp ../Runtime/multicoregc.h ./
-cp ../Runtime/multicoregarbage.h ./
-cp ../Runtime/multicorehelper.h ./
-cp ../Runtime/MGCHash.h ./
+cp $BAMBOORUNTIME/multicoretask.c ./
+cp $BAMBOORUNTIME/multicoreruntime.c ./
+cp $BAMBOORUNTIME/multicoremem.c ./
+cp $BAMBOORUNTIME/multicoregarbage.c ./
+cp $BAMBOORUNTIME/GCSharedHash.c ./
+cp $BAMBOORUNTIME/MGCHash.c ./
+cp $BAMBOORUNTIME/multicoreruntime.h ./
+cp $BAMBOORUNTIME/multicoremem.h ./
+cp $BAMBOORUNTIME/multicoregarbage.h ./
+cp $BAMBOORUNTIME/multicorecache.h ./
+cp $BAMBOORUNTIME/multicoregc.h ./
+cp $BAMBOORUNTIME/multicorehelper.h ./
+cp $BAMBOORUNTIME/GCSharedHash.h ./
+cp $BAMBOORUNTIME/MGCHash.h ./
 cp ../Tilera/Runtime/*.c ./
 cp ../Tilera/Runtime/*.h ./
 cp ../Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/*.c ./
@@ -1022,6 +1229,11 @@ fi
 #then # TILERAMEMPROFFLAG
 cp ../Tilera/Runtime/$TILERA_INDIR/linux_client.c ./
 #fi
+if $MGCFLAG
+then
+cp ../Tilera/Runtime/MGC/*.c ./
+cp ../Tilera/Runtime/MGC/*.h ./
+fi
 cp ../Tilera/lib/* ./
 cp ../$tmpbuilddirectory/*.c ./
 cp ../$tmpbuilddirectory/*.h ./
@@ -1036,7 +1248,8 @@ INCLUDES="$INCLUDES -I$ROBUSTROOT/Runtime -I. -IRuntime/include \
 
 if $MULTICOREFLAG
 then
-RUNTIMEFILE="$ROBUSTROOT/Runtime/multicoreruntime.c $ROBUSTROOT/Runtime/multicoretask.c"
+RUNTIMEFILE="$BAMBOORUNTIME/multicoreruntime.c $BAMBOORUNTIME/multicoretask.c"
+INCLUDES="$INCLUDES -I$BAMBOORUNTIME"
 else
 RUNTIMEFILE="$ROBUSTROOT/Runtime/runtime.c $ROBUSTROOT/Runtime/task.c"
 fi
@@ -1046,9 +1259,15 @@ $ROBUSTROOT/Runtime/file.c $ROBUSTROOT/Runtime/Queue.c \
 $ROBUSTROOT/Runtime/SimpleHash.c $ROBUSTROOT/Runtime/option.c \
 $ROBUSTROOT/Runtime/ObjectHash.c \
 $ROBUSTROOT/Runtime/garbage.c $ROBUSTROOT/Runtime/socket.c \
+$ROBUSTROOT/Runtime/taskgarbage.c $ROBUSTROOT/Runtime/oojgarbage.c \
 $ROBUSTROOT/Runtime/math.c \
 $ROBUSTROOT/Runtime/GenericHashtable.c $ROBUSTROOT/Runtime/object.c"
 
+if $JNI
+then
+FILES="$FILES $ROBUSTROOT/Runtime/jni/jni.c $ROBUSTROOT/Runtime/jni/jni-stuff.c"
+fi
+
 if $NUMA
 then
 FILES="$FILES $ROBUSTROOT/Runtime/affinity.c"
@@ -1109,7 +1328,7 @@ fi
 
 if $RCR
 then
-FILES="$FILES $tmpbuilddirectory/RuntimeConflictResolver.c $ROBUSTROOT/Runtime/oooJava/hashRCR.c $ROBUSTROOT/Runtime/oooJava/Queue_RCR.c
+FILES="$FILES $tmpbuilddirectory/RuntimeConflictResolver.c $ROBUSTROOT/Runtime/oooJava/hashRCR.c $ROBUSTROOT/Runtime/oooJava/Queue_RCR.c $ROBUSTROOT/Runtime/oooJava/hashStructure.c $ROBUSTROOT/Runtime/oooJava/trqueue.c $ROBUSTROOT/Runtime/oooJava/rcr_runtime.c"
 fi
 
 if $MLP_ON
@@ -1117,6 +1336,10 @@ then
 FILES="$FILES $ROBUSTROOT/Runtime/mlp_runtime.c"
 FILES="$FILES $ROBUSTROOT/Runtime/psemaphore.c"
 FILES="$FILES $ROBUSTROOT/Runtime/workschedule.c"
+if ! $SQUEUE
+then
+FILES="$FILES $ROBUSTROOT/Runtime/deque.c"
+fi
 fi
 
 if $RECOVERFLAG
@@ -1160,6 +1383,9 @@ then
 EXTRAOPTIONS="$EXTRAOPTIONS -ldmalloc -DDMALLOC"
 fi
 
+echo Compiling C...
+echo EXTRAOPTIONS=$EXTRAOPTIONS
+
 if $ASSEMBLY
 then
 gcc -S $INCLUDES $EXTRAOPTIONS -DPRECISE_GC \
@@ -1168,13 +1394,21 @@ fi
 
 if $MULTICOREFLAG
 then
-gcc $INCLUDES $EXTRAOPTIONS \
-$tmpbuilddirectory/methods.c $FILES -lm -o $MAINFILE.bin
+NONMULTICOREOPTS=
 else
-gcc $INCLUDES $EXTRAOPTIONS -DPRECISE_GC \
-$tmpbuilddirectory/methods.c $FILES -lm -o $MAINFILE.bin
+NONMULTICOREOPTS=-DPRECISE_GC
+fi
+
+if $SRCAFTERPP
+then
+gcc -E $INCLUDES $EXTRAOPTIONS $NONMULTICOREOPTS \
+$tmpbuilddirectory/methods.c $FILES > tmp.c
 fi
 
+gcc $INCLUDES $EXTRAOPTIONS $NONMULTICOREOPTS \
+$tmpbuilddirectory/methods.c $FILES -lm -o $MAINFILE.bin
+
+
 fi #!RAWFLAG