Minor changes: Removing vestigial code
[IRC.git] / Robust / src / IR / Flat / RuntimeConflictResolver.java
index 628a669bc58060f9ca4577bb29e20e26e3a04b2e..e71407d57a6aaa5a629f7d37a717d8f0b084126b 100644 (file)
@@ -3,12 +3,17 @@ import java.io.File;
 import java.io.FileNotFoundException;
 import java.io.PrintWriter;
 import java.util.ArrayList;
+import java.util.Collection;
 import java.util.HashSet;
 import java.util.Hashtable;
 import java.util.Iterator;
 import java.util.Set;
+import java.util.Vector;
+import Util.Tuple;
 import Analysis.Disjoint.*;
+import Analysis.MLP.CodePlan;
 import IR.TypeDescriptor;
+import Analysis.OoOJava.OoOJavaAnalysis;
 
 /* An instance of this class manages all OoOJava coarse-grained runtime conflicts
  * by generating C-code to either rule out the conflict at runtime or resolve one.
@@ -23,7 +28,7 @@ import IR.TypeDescriptor;
  * Note: All computation is done upon closing the object. Steps 1-3 only input data
  */
 public class RuntimeConflictResolver {
-  public static final boolean javaDebug = false;
+  public static final boolean javaDebug = true;
   public static final boolean cSideDebug = false;
   
   private PrintWriter cFile;
@@ -32,13 +37,16 @@ public class RuntimeConflictResolver {
   //This keeps track of taints we've traversed to prevent printing duplicate traverse functions
   //The Integer keeps track of the weakly connected group it's in (used in enumerateHeapRoots)
   private Hashtable<Taint, Integer> doneTaints;
+  private Hashtable<Tuple, Integer> idMap=new Hashtable<Tuple,Integer>();
   private Hashtable<Taint, Set<Effect>> globalEffects;
   private Hashtable<Taint, Set<Effect>> globalConflicts;
   private ArrayList<TraversalInfo> toTraverse;
 
+  public int currentID=1;
+
   // initializing variables can be found in printHeader()
   private static final String getAllocSiteInC = "->allocsite";
-  private static final String queryVistedHashtable = "hashRCRInsert(";
+  private static final String queryVistedHashtable = "hashRCRInsert";
   private static final String addToQueueInC = "enqueueRCRQueue(";
   private static final String dequeueFromQueueInC = "dequeueRCRQueue()";
   private static final String clearQueue = "resetRCRQueue()";
@@ -47,15 +55,6 @@ public class RuntimeConflictResolver {
   private static final String deallocVisitedHashTable = "hashRCRDelete()";
   private static final String resetVisitedHashTable = "hashRCRreset()";
   
-  //TODO find correct strings for these
-  private static final String addCheckFromHashStructure = "checkFromHashStructure(";
-  private static final String putWaitingQueueBlock = "putWaitingQueueBlock(";  //lifting of blocks will be done by hashtable.
-  private static final String putIntoAllocQueue = "putIntoWaitingQ(";
-  private static final int noConflict = 0;
-  private static final int conflictButTraverserCanContinue = 1;
-  private static final int conflictButTraverserCannotContinue = 2;
-  private static final int allocQueueIsNotEmpty = 0;
-  
   // Hashtable provides fast access to heaproot # lookups
   private Hashtable<Taint, WeaklyConectedHRGroup> connectedHRHash;
   private ArrayList<WeaklyConectedHRGroup> num2WeaklyConnectedHRGroup;
@@ -63,22 +62,25 @@ public class RuntimeConflictResolver {
   private int weaklyConnectedHRCounter;
   private ArrayList<TaintAndInternalHeapStructure> pendingPrintout;
   private EffectsTable effectsLookupTable;
+  private OoOJavaAnalysis oooa;
 
-  public RuntimeConflictResolver(String buildir) 
-  throws FileNotFoundException {
+  public RuntimeConflictResolver(String buildir, OoOJavaAnalysis oooa) throws FileNotFoundException {
     String outputFile = buildir + "RuntimeConflictResolver";
-    
+    this.oooa=oooa;
+
     cFile = new PrintWriter(new File(outputFile + ".c"));
     headerFile = new PrintWriter(new File(outputFile + ".h"));
     
-    cFile.append("#include \"" + hashAndQueueCFileDir + "hashRCR.h\"\n#include \""
-        + hashAndQueueCFileDir + "Queue_RCR.h\"\n#include <stdlib.h>\n");
-    cFile.append("#include \"classdefs.h\"\n");
-    cFile.append("#include \"RuntimeConflictResolver.h\"\n");
-    cFile.append("#include \"hashStructure.h\"\n");
+    cFile.println("#include \"" + hashAndQueueCFileDir + "hashRCR.h\"\n#include \""
+        + hashAndQueueCFileDir + "Queue_RCR.h\"\n#include <stdlib.h>");
+    cFile.println("#include \"classdefs.h\"");
+    cFile.println("#include \"structdefs.h\"");
+    cFile.println("#include \"mlp_runtime.h\"");
+    cFile.println("#include \"RuntimeConflictResolver.h\"");
+    cFile.println("#include \"hashStructure.h\"");
     
-    headerFile.append("#ifndef __3_RCR_H_\n");
-    headerFile.append("#define __3_RCR_H_\n");
+    headerFile.println("#ifndef __3_RCR_H_");
+    headerFile.println("#define __3_RCR_H_");
     
     doneTaints = new Hashtable<Taint, Integer>();
     connectedHRHash = new Hashtable<Taint, WeaklyConectedHRGroup>();
@@ -105,6 +107,71 @@ public class RuntimeConflictResolver {
       System.out.println("====================END  LIST====================");
     }
   }
+
+  public void init() {
+    // Go through the SESE's
+    for (Iterator<FlatSESEEnterNode> seseit = oooa.getAllSESEs().iterator(); seseit.hasNext();) {
+      FlatSESEEnterNode fsen = seseit.next();
+      Analysis.OoOJava.ConflictGraph conflictGraph;
+      Hashtable<Taint, Set<Effect>> conflicts;
+      System.out.println("-------");
+      System.out.println(fsen);
+      System.out.println(fsen.getIsCallerSESEplaceholder());
+      System.out.println(fsen.getParent());
+
+      if (fsen.getParent() != null) {
+        conflictGraph = oooa.getConflictGraph(fsen.getParent());
+        System.out.println("CG=" + conflictGraph);
+        if (conflictGraph != null)
+          System.out.println("Conflicts=" + conflictGraph.getConflictEffectSet(fsen));
+      }
+
+      if (!fsen.getIsCallerSESEplaceholder() && fsen.getParent() != null
+          && (conflictGraph = oooa.getConflictGraph(fsen.getParent())) != null
+          && (conflicts = conflictGraph.getConflictEffectSet(fsen)) != null) {
+        FlatMethod fm = fsen.getfmEnclosing();
+        ReachGraph rg = oooa.getDisjointAnalysis().getReachGraph(fm.getMethod());
+        if (cSideDebug)
+          rg.writeGraph("RCR_RG_SESE_DEBUG");
+
+        addToTraverseToDoList(fsen, rg, conflicts);
+      }
+    }
+    // Go through the stall sites
+    for (Iterator<FlatNode> codeit = oooa.getNodesWithPlans().iterator(); codeit.hasNext();) {
+      FlatNode fn = codeit.next();
+      CodePlan cp = oooa.getCodePlan(fn);
+      FlatSESEEnterNode currentSESE = cp.getCurrentSESE();
+      Analysis.OoOJava.ConflictGraph graph = oooa.getConflictGraph(currentSESE);
+
+      if (graph != null) {
+        Set<Analysis.OoOJava.SESELock> seseLockSet = oooa.getLockMappings(graph);
+        Set<Analysis.OoOJava.WaitingElement> waitingElementSet =
+            graph.getStallSiteWaitingElementSet(fn, seseLockSet);
+
+        if (waitingElementSet.size() > 0) {
+          for (Iterator<Analysis.OoOJava.WaitingElement> iterator = waitingElementSet.iterator(); iterator.hasNext();) {
+            Analysis.OoOJava.WaitingElement waitingElement =
+                (Analysis.OoOJava.WaitingElement) iterator.next();
+
+            Analysis.OoOJava.ConflictGraph conflictGraph = graph;
+            Hashtable<Taint, Set<Effect>> conflicts;
+            ReachGraph rg = oooa.getDisjointAnalysis().getReachGraph(currentSESE.getmdEnclosing());
+            if (cSideDebug) {
+              rg.writeGraph("RCR_RG_STALLSITE_DEBUG");
+            }
+            if ((conflictGraph != null) && (conflicts = graph.getConflictEffectSet(fn)) != null
+                && (rg != null)) {
+              addToTraverseToDoList(fn, waitingElement.getTempDesc(), rg, conflicts);
+            }
+          }
+        }
+      }
+    }
+
+    buildEffectsLookupStructure();
+    runAllTraversals();
+  }
   
   /*
    * Basic Strategy:
@@ -118,16 +185,16 @@ public class RuntimeConflictResolver {
    * 5) Print c methods by walking internal representation
    */
   
-  public void addToTraverseToDoList(FlatSESEEnterNode rblock, ReachGraph rg, Hashtable<Taint, Set<Effect>> conflicts) {
+  public void addToTraverseToDoList(FlatSESEEnterNode rblock, ReachGraph rg, 
+      Hashtable<Taint, Set<Effect>> conflicts) {
     //Add to todo list
     toTraverse.add(new TraversalInfo(rblock, rg));
-    
+
     //Add to Global conflicts
     for(Taint t: conflicts.keySet()) {
-      if(globalConflicts.contains(t)) {
+      if(globalConflicts.containsKey(t)) {
         globalConflicts.get(t).addAll(conflicts.get(t));
-      }
-      else {
+      } else {
         globalConflicts.put(t, conflicts.get(t));
       }
     }
@@ -139,44 +206,43 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     toTraverse.add(new TraversalInfo(fn, rg, tempDesc));
     
     for(Taint t: conflicts.keySet()) {
-      if(globalConflicts.contains(t)) {
+      if(globalConflicts.containsKey(t)) {
         globalConflicts.get(t).addAll(conflicts.get(t));
-      }
-      else {
+      } else {
         globalConflicts.put(t, conflicts.get(t));
       }
     }
   }
 
-  private void traverseSESEBlock(FlatSESEEnterNode rblock,
-      ReachGraph rg) {
-    Set<TempDescriptor> inVars = rblock.getInVarSet();
+  private void traverseSESEBlock(FlatSESEEnterNode rblock, ReachGraph rg) {
+    Collection<TempDescriptor> inVars = rblock.getInVarSet();
     
     if (inVars.size() == 0)
       return;
+    System.out.println("RBLOCK:"+rblock);
+    System.out.println("["+inVars+"]");
     
     // For every non-primitive variable, generate unique method
-    // Special Note: The Criteria for executing printCMethod in this loop should match
-    // exactly the criteria in buildcode.java to invoke the generated C method(s). 
     for (TempDescriptor invar : inVars) {
       TypeDescriptor type = invar.getType();
-      if(type == null || type.isPrimitive()) {
+      if(isReallyAPrimitive(type)) {
         continue;
       }
-
-      //created stores nodes with specific alloc sites that have been traversed while building
-      //internal data structure. It is later traversed sequentially to find inset variables and
+      System.out.println(invar);
+      //"created" stores nodes with specific alloc sites that have been traversed while building
+      //internal data structure. Created is later traversed sequentially to find inset variables and
       //build output code.
-      Hashtable<AllocSite, ConcreteRuntimeObjNode> created = new Hashtable<AllocSite, ConcreteRuntimeObjNode>();
+      //NOTE: Integer stores Allocation Site ID in hashtable
+      Hashtable<Integer, ConcreteRuntimeObjNode> created = new Hashtable<Integer, ConcreteRuntimeObjNode>();
       VariableNode varNode = rg.getVariableNodeNoMutation(invar);
       Taint taint = getProperTaintForFlatSESEEnterNode(rblock, varNode, globalEffects);
       if (taint == null) {
         printDebug(javaDebug, "Null FOR " +varNode.getTempDescriptor().getSafeSymbol() + rblock.toPrettyString());
-        return;
+        continue;
       }
       
       //This is to prevent duplicate traversals from being generated 
-      if(doneTaints.containsKey(taint) && doneTaints.get(taint) != null)
+      if(doneTaints.containsKey(taint))
         return;
       
       doneTaints.put(taint, traverserIDCounter++);
@@ -185,23 +251,31 @@ public class RuntimeConflictResolver {
       
       //This will add the taint to the printout, there will be NO duplicates (checked above)
       if(!created.isEmpty()) {
-        //TODO change invocation to new format
-        //rblock.addInVarForDynamicCoarseConflictResolution(invar);
+        for(Iterator<ConcreteRuntimeObjNode> it=created.values().iterator();it.hasNext();) {
+          ConcreteRuntimeObjNode obj=it.next();
+          if (obj.hasPrimitiveConflicts()||obj.decendantsConflict()) {
+            rblock.addInVarForDynamicCoarseConflictResolution(invar);
+            break;
+          }
+        }
+        
         pendingPrintout.add(new TaintAndInternalHeapStructure(taint, created));
       }
     }
   }
-  
 
-  private void traverseStallSite(
-      FlatNode enterNode,
-      TempDescriptor invar,
-      ReachGraph rg) {
+  //This extends a tempDescriptor's isPrimitive test by also excluding primitive arrays. 
+  private boolean isReallyAPrimitive(TypeDescriptor type) {
+    return (type.isPrimitive() && !type.isArray());
+  }
+  
+  private void traverseStallSite(FlatNode enterNode, TempDescriptor invar, ReachGraph rg) {
     TypeDescriptor type = invar.getType();
-    if(type == null || type.isPrimitive()) {
+    if(type == null || isReallyAPrimitive(type)) {
       return;
     }
-    Hashtable<AllocSite, ConcreteRuntimeObjNode> created = new Hashtable<AllocSite, ConcreteRuntimeObjNode>();
+    
+    Hashtable<Integer, ConcreteRuntimeObjNode> created = new Hashtable<Integer, ConcreteRuntimeObjNode>();
     VariableNode varNode = rg.getVariableNodeNoMutation(invar);
     Taint taint = getProperTaintForEnterNode(enterNode, varNode, globalEffects);
     
@@ -210,7 +284,7 @@ public class RuntimeConflictResolver {
       return;
     }        
     
-    if(doneTaints.containsKey(taint) && doneTaints.get(taint) != null)
+    if(doneTaints.containsKey(taint))
       return;
     
     doneTaints.put(taint, traverserIDCounter++);
@@ -225,19 +299,27 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     String flatname;
     if(fn instanceof FlatSESEEnterNode) {
       flatname = ((FlatSESEEnterNode) fn).getPrettyIdentifier();
-    }
-    else {
+    } else {
       flatname = fn.toString();
     }
     
-    return "traverse___" + removeInvalidChars(invar.getSafeSymbol()) + 
+    return "traverse___" + invar.getSafeSymbol() + 
     removeInvalidChars(flatname) + "___("+varString+");";
   }
+
+  public int getTraverserID(TempDescriptor invar, FlatNode fn) {
+    Tuple t=new Tuple(invar, fn);
+    if (idMap.containsKey(t))
+      return idMap.get(t).intValue();
+    int value=currentID++;
+    idMap.put(t, new Integer(value));
+    return value;
+  }
   
   public String removeInvalidChars(String in) {
     StringBuilder s = new StringBuilder(in);
     for(int i = 0; i < s.length(); i++) {
-      if(s.charAt(i) == ' ' || s.charAt(i) == '.' || s.charAt(i) == '=') {
+      if(s.charAt(i) == ' ' || s.charAt(i) == '.' || s.charAt(i) == '='||s.charAt(i)=='['||s.charAt(i)==']') {
         s.deleteCharAt(i);
         i--;
       }
@@ -246,52 +328,48 @@ public class RuntimeConflictResolver {
   }
 
   public void close() {
-    buildEffectsLookupStructure();
-    runAllTraverserals();
-    
     //prints out all generated code
     for(TaintAndInternalHeapStructure ths: pendingPrintout) {
       printCMethod(ths.nodesInHeap, ths.t);
     }
     
-    //Prints out the master traverser Invocation that'll call all other traverser
+    //Prints out the master traverser Invocation that'll call all other traversers
     //based on traverserID
     printMasterTraverserInvocation();
+    printResumeTraverserInvocation();
     
     //TODO this is only temporary, remove when thread local vars implemented. 
     createMasterHashTableArray();
     
     // Adds Extra supporting methods
-    cFile.append("void initializeStructsRCR() { " + mallocVisitedHashtable + "; " + clearQueue + "; }");
-    cFile.append("void destroyRCR() { " + deallocVisitedHashTable + "; }\n");
+    cFile.println("void initializeStructsRCR() {\n  " + mallocVisitedHashtable + ";\n  " + clearQueue + ";\n}");
+    cFile.println("void destroyRCR() {\n  " + deallocVisitedHashTable + ";\n}");
     
-    headerFile.append("void initializeStructsRCR(); \nvoid destroyRCR(); \n");
-    headerFile.append("#endif\n");
+    headerFile.println("void initializeStructsRCR();\nvoid destroyRCR();");
+    headerFile.println("#endif\n");
 
     cFile.close();
     headerFile.close();
   }
 
   //Builds Effects Table and runs the analysis on them to get weakly connected HRs
-  //SPECIAL NOTE: Only runs after we've taken all the conflicts 
+  //SPECIAL NOTE: Only runs after we've taken all the conflicts and effects
   private void buildEffectsLookupStructure(){
     effectsLookupTable = new EffectsTable(globalEffects, globalConflicts);
-    effectsLookupTable.runAnaylsis();
+    effectsLookupTable.runAnalysis();
     enumerateHeaproots();
   }
 
-  private void runAllTraverserals() {
+  private void runAllTraversals() {
     for(TraversalInfo t: toTraverse) {
       printDebug(javaDebug, "Running Traversal a traversal on " + t.f);
       
       if(t.f instanceof FlatSESEEnterNode) {
         traverseSESEBlock((FlatSESEEnterNode)t.f, t.rg);
-      }
-      else {
+      } else {
         if(t.invar == null) {
           System.out.println("RCR ERROR: Attempted to run a stall site traversal with NO INVAR");
-        }
-        else {
+        } else {
           traverseStallSite(t.f, t.invar, t.rg);
         }
       }
@@ -301,46 +379,84 @@ public class RuntimeConflictResolver {
 
   //TODO: This is only temporary, remove when thread local variables are functional. 
   private void createMasterHashTableArray() {
-    headerFile.append("void createAndFillMasterHashStructureArray();");
-    cFile.append("void createAndFillMasterHashStructureArray() { " +
-               "createMasterHashTableArray("+weaklyConnectedHRCounter + ");");
+    headerFile.println("void createAndFillMasterHashStructureArray();");
+    cFile.println("void createAndFillMasterHashStructureArray() {\n" +
+               "  rcr_createMasterHashTableArray("+weaklyConnectedHRCounter + ");");
     
     for(int i = 0; i < weaklyConnectedHRCounter; i++) {
-      cFile.append("allHashStructures["+i+"] = (HashStructure *) createhashTable("+num2WeaklyConnectedHRGroup.get(i).connectedHRs.size()+");}");
+      cFile.println("  allHashStructures["+i+"] = (HashStructure *) rcr_createHashtable("+num2WeaklyConnectedHRGroup.get(i).connectedHRs.size()+");");
     }
+    cFile.println("}");
   }
 
-  //This will print the traverser invocation that takes in a traverserID and 
-  //starting ptr
   private void printMasterTraverserInvocation() {
-    headerFile.println("\nint traverse(void * startingPtr, int traverserID);");
-    cFile.println("\nint traverse(void * startingPtr, int traverserID) {" +
-               "switch(traverserID) { ");
+    headerFile.println("\nint tasktraverse(SESEcommon * record);");
+    cFile.println("\nint tasktraverse(SESEcommon * record) {");
+    cFile.println("  if(!CAS(&record->rcrstatus,1,2)) return;");
+    cFile.println("  switch(record->classID) {");
+    
+    for(Iterator<FlatSESEEnterNode> seseit=oooa.getAllSESEs().iterator();seseit.hasNext();) {
+      FlatSESEEnterNode fsen=seseit.next();
+      cFile.println(    "    /* "+fsen.getPrettyIdentifier()+" */");
+      cFile.println(    "    case "+fsen.getIdentifier()+": {");
+      cFile.println(    "      "+fsen.getSESErecordName()+" * rec=("+fsen.getSESErecordName()+" *) record;");
+      Vector<TempDescriptor> invars=fsen.getInVarsForDynamicCoarseConflictResolution();
+      for(int i=0;i<invars.size();i++) {
+        TempDescriptor tmp=invars.get(i);
+        cFile.println("      " + this.getTraverserInvocation(tmp, "rec->"+tmp+", rec", fsen));
+      }
+      cFile.println(    "    }");
+      cFile.println(    "    break;");
+    }
     
     for(Taint t: doneTaints.keySet()) {
-      cFile.println("  case " + doneTaints.get(t)+ ": ");
-      if(t.isRBlockTaint()) {
-        cFile.println("    " + this.getTraverserInvocation(t.getVar(), "startingPtr", t.getSESE()));
+      if (t.isStallSiteTaint()){
+        cFile.println(    "    case -" + getTraverserID(t.getVar(), t.getStallSite())+ ": {");
+        cFile.println(    "      SESEstall * rec=(SESEstall*) record;");
+        cFile.println(    "      " + this.getTraverserInvocation(t.getVar(), "rec->___obj___, rec", t.getStallSite())+";");
+        cFile.println(    "    }");
+        cFile.println("    break;");
       }
-      else if (t.isStallSiteTaint()){
-        cFile.println("    " + this.getTraverserInvocation(t.getVar(), "startingPtr", t.getStallSite()));
+    }
+
+    cFile.println("    default:\n    printf(\"Invalid SESE ID was passed in: %d.\\n\",record->classID);\n    break;");
+    
+    cFile.println("  }");
+    cFile.println("}");
+  }
+
+
+  //This will print the traverser invocation that takes in a traverserID and starting ptr
+  private void printResumeTraverserInvocation() {
+    headerFile.println("\nint traverse(void * startingPtr, SESEcommon * record, int traverserID);");
+    cFile.println("\nint traverse(void * startingPtr, SESEcommon *record, int traverserID) {");
+    cFile.println("  switch(traverserID) {");
+    
+    for(Taint t: doneTaints.keySet()) {
+      cFile.println("  case " + doneTaints.get(t)+ ":");
+      if(t.isRBlockTaint()) {
+        cFile.println("    " + this.getTraverserInvocation(t.getVar(), "startingPtr, ("+t.getSESE().getSESErecordName()+" *)record", t.getSESE()));
+      } else if (t.isStallSiteTaint()){
+        cFile.println("/*    " + this.getTraverserInvocation(t.getVar(), "startingPtr, record", t.getStallSite())+"*/");
       } else {
         System.out.println("RuntimeConflictResolver encountered a taint that is neither SESE nor stallsite: " + t);
       }
+      cFile.println("    break;");
     }
     
     if(RuntimeConflictResolver.cSideDebug) {
-      cFile.println(" default: printf(\"invalid traverser ID %u was passed in.\\n\", traverserID);\n break; ");
+      cFile.println("  default:\n    printf(\"Invalid traverser ID %u was passed in.\\n\", traverserID);\n    break;");
     } else {
-      cFile.println(" default: break; ");
+      cFile.println("  default:\n    break;");
     }
     
-    cFile.println("}}");
+    cFile.println(" }");
+    cFile.println("}");
   }
 
   private void createConcreteGraph(
       EffectsTable table,
-      Hashtable<AllocSite, ConcreteRuntimeObjNode> created, 
+      Hashtable<Integer, ConcreteRuntimeObjNode> created, 
       VariableNode varNode, 
       Taint t) {
     
@@ -349,13 +465,13 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     if (table == null)
       return;
 
-    Iterator<RefEdge> possibleEdges = varNode.iteratorToReferencees();    
+    Iterator<RefEdge> possibleEdges = varNode.iteratorToReferencees();
     while (possibleEdges.hasNext()) {
       RefEdge edge = possibleEdges.next();
       assert edge != null;
 
       ConcreteRuntimeObjNode singleRoot = new ConcreteRuntimeObjNode(edge.getDst(), true);
-      AllocSite rootKey = singleRoot.allocSite;
+      int rootKey = singleRoot.allocSite.getUniqueAllocSiteID();
 
       if (!created.containsKey(rootKey)) {
         created.put(rootKey, singleRoot);
@@ -363,58 +479,12 @@ public class RuntimeConflictResolver {
       }
     }
   }
-  
-  //This code is the old way of generating an effects lookup table. 
-  //The new way is to instantiate an EffectsGroup
-  @Deprecated
-  private Hashtable<AllocSite, EffectsGroup> generateEffectsLookupTable(
-      Taint taint, Hashtable<Taint, 
-      Set<Effect>> effects,
-      Hashtable<Taint, Set<Effect>> conflicts) {
-    if(taint == null)
-      return null;
-    
-    Set<Effect> localEffects = effects.get(taint);
-    Set<Effect> localConflicts = conflicts.get(taint);
-    
-    //Debug Code for manually checking effects
-    if(javaDebug) {
-      printEffectsAndConflictsSets(taint, localEffects, localConflicts);
-    }
-    
-    if (localEffects == null || localEffects.isEmpty() || localConflicts == null || localConflicts.isEmpty())
-      return null;
-    
-    Hashtable<AllocSite, EffectsGroup> lookupTable = new Hashtable<AllocSite, EffectsGroup>();
-    
-    for (Effect e : localEffects) {
-      boolean conflict = localConflicts.contains(e);
-      AllocSite key = e.getAffectedAllocSite();
-      EffectsGroup myEffects = lookupTable.get(key);
-      
-      if(myEffects == null) {
-        myEffects = new EffectsGroup();
-        lookupTable.put(key, myEffects);
-      }
-      
-      if(e.getField().getType().isPrimitive()) {
-        if(conflict) {
-          myEffects.addPrimative(e);
-        }
-      }
-      else {
-        myEffects.addObjEffect(e, conflict);
-      }      
-    }
-    
-    return lookupTable;
-  }
 
   // Plan is to add stuff to the tree depth-first sort of way. That way, we can
   // propagate up conflicts
   private void createHelper(ConcreteRuntimeObjNode curr, 
                             Iterator<RefEdge> edges, 
-                            Hashtable<AllocSite, ConcreteRuntimeObjNode> created,
+                            Hashtable<Integer, ConcreteRuntimeObjNode> created,
                             EffectsTable table, 
                             Taint taint) {
     assert table != null;
@@ -433,23 +503,22 @@ public class RuntimeConflictResolver {
         //If there are no effects, then there's no point in traversing this edge
         if(effectsForGivenField != null) {
           HeapRegionNode childHRN = edge.getDst();
-          AllocSite childKey = childHRN.getAllocSite();
+          int childKey = childHRN.getAllocSite().getUniqueAllocSiteID();
           boolean isNewChild = !created.containsKey(childKey);
           ConcreteRuntimeObjNode child; 
           
           if(isNewChild) {
             child = new ConcreteRuntimeObjNode(childHRN, false);
             created.put(childKey, child);
-          }
-          else {
+          } else {
             child = created.get(childKey);
           }
     
           curr.addObjChild(field, child, effectsForGivenField);
           
           if (effectsForGivenField.hasConflict()) {
-            child.hasPotentialToBeIncorrectDueToConflict = true;
-            propogateObjConflict(curr, child);
+            child.hasPotentialToBeIncorrectDueToConflict |= effectsForGivenField.hasReadConflict;
+            propagateObjConflict(curr, child);
           }
           
           if(effectsForGivenField.hasReadEffect) {
@@ -458,15 +527,14 @@ public class RuntimeConflictResolver {
             //If isNewChild, flag propagation will be handled at recursive call
             if(isNewChild) {
               createHelper(child, childHRN.iteratorToReferencees(), created, table, taint);
-            }
-            else {
+            } else {
             //This makes sure that all conflicts below the child is propagated up the referencers.
               if(child.decendantsPrimConflict || child.hasPrimitiveConflicts()) {
-                propogatePrimConflict(child, child.enqueueToWaitingQueueUponConflict);
+                propagatePrimConflict(child, child.enqueueToWaitingQueueUponConflict);
               }
               
               if(child.decendantsObjConflict) {
-                propogateObjConflict(child, child.enqueueToWaitingQueueUponConflict);
+                propagateObjConflict(child, child.enqueueToWaitingQueueUponConflict);
               }
             }
           }
@@ -475,61 +543,58 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     }
     
     //Handles primitives
-    if(currEffects.hasPrimativeConflicts()) {
-      curr.conflictingPrimitiveFields = currEffects.primativeConflictingFields; 
+    curr.primitiveConflictingFields = currEffects.primitiveConflictingFields; 
+    if(currEffects.hasPrimitiveConflicts()) {
       //Reminder: primitive conflicts are abstracted to object. 
-      curr.hasPotentialToBeIncorrectDueToConflict = true;
-      propogatePrimConflict(curr, curr);
+      propagatePrimConflict(curr, curr);
     }
   }
 
   // This will propagate the conflict up the data structure.
-  private void propogateObjConflict(ConcreteRuntimeObjNode curr, HashSet<ConcreteRuntimeObjNode> pointsOfAccess) {
+  private void propagateObjConflict(ConcreteRuntimeObjNode curr, HashSet<ConcreteRuntimeObjNode> pointsOfAccess) {
     for(ConcreteRuntimeObjNode referencer: curr.parentsWithReadToNode) {
       if(curr.parentsThatWillLeadToConflicts.add(referencer) || //case where referencee has never seen referncer
           (pointsOfAccess != null && referencer.addPossibleWaitingQueueEnqueue(pointsOfAccess))) // case where referencer has never seen possible unresolved referencee below 
       {
         referencer.decendantsObjConflict = true;
-        propogateObjConflict(referencer, pointsOfAccess);
+        propagateObjConflict(referencer, pointsOfAccess);
       }
     }
   }
   
-  private void propogateObjConflict(ConcreteRuntimeObjNode curr, ConcreteRuntimeObjNode pointOfAccess) {
+  private void propagateObjConflict(ConcreteRuntimeObjNode curr, ConcreteRuntimeObjNode pointOfAccess) {
     for(ConcreteRuntimeObjNode referencer: curr.parentsWithReadToNode) {
       if(curr.parentsThatWillLeadToConflicts.add(referencer) || //case where referencee has never seen referncer
           (pointOfAccess != null && referencer.addPossibleWaitingQueueEnqueue(pointOfAccess))) // case where referencer has never seen possible unresolved referencee below 
       {
         referencer.decendantsObjConflict = true;
-        propogateObjConflict(referencer, pointOfAccess);
+        propagateObjConflict(referencer, pointOfAccess);
       }
     }
   }
   
-  private void propogatePrimConflict(ConcreteRuntimeObjNode curr, HashSet<ConcreteRuntimeObjNode> pointsOfAccess) {
+  private void propagatePrimConflict(ConcreteRuntimeObjNode curr, HashSet<ConcreteRuntimeObjNode> pointsOfAccess) {
     for(ConcreteRuntimeObjNode referencer: curr.parentsWithReadToNode) {
       if(curr.parentsThatWillLeadToConflicts.add(referencer) || //same cases as above
           (pointsOfAccess != null && referencer.addPossibleWaitingQueueEnqueue(pointsOfAccess))) 
       {
         referencer.decendantsPrimConflict = true;
-        propogatePrimConflict(referencer, pointsOfAccess);
+        propagatePrimConflict(referencer, pointsOfAccess);
       }
     }
   }
   
-  private void propogatePrimConflict(ConcreteRuntimeObjNode curr, ConcreteRuntimeObjNode pointOfAccess) {
+  private void propagatePrimConflict(ConcreteRuntimeObjNode curr, ConcreteRuntimeObjNode pointOfAccess) {
     for(ConcreteRuntimeObjNode referencer: curr.parentsWithReadToNode) {
       if(curr.parentsThatWillLeadToConflicts.add(referencer) || //same cases as above
           (pointOfAccess != null && referencer.addPossibleWaitingQueueEnqueue(pointOfAccess))) 
       {
         referencer.decendantsPrimConflict = true;
-        propogatePrimConflict(referencer, pointOfAccess);
+        propagatePrimConflict(referencer, pointOfAccess);
       }
     }
   }
   
-  
-
   /*
    * This method generates a C method for every inset variable and rblock. 
    * 
@@ -542,77 +607,108 @@ public class RuntimeConflictResolver {
    *  signal a conflict within itself. 
    */
   
-  private void printCMethod(Hashtable<AllocSite, ConcreteRuntimeObjNode> created, Taint taint) {
-    //This hash table keeps track of all the case statements generated. Although it may seem a bit much
-    //for its purpose, I think it may come in handy later down the road to do it this way. 
-    //(i.e. what if we want to eliminate some cases? Or build filter for 1 case)
+  private void printCMethod(Hashtable<Integer, ConcreteRuntimeObjNode> created, Taint taint) {
     String inVar = taint.getVar().getSafeSymbol();
     String rBlock;
     
     if(taint.isStallSiteTaint()) {
       rBlock = taint.getStallSite().toString();
-    }
-    else if(taint.isRBlockTaint()) {
-      rBlock = taint.getSESE().toPrettyString();
-    }
-    else {
+    } else if(taint.isRBlockTaint()) {
+      rBlock = taint.getSESE().getPrettyIdentifier();
+    } else {
       System.out.println("RCR CRITICAL ERROR: TAINT IS NEITHER A STALLSITE NOR SESE! " + taint.toString());
       return;
     }
     
+    //This hash table keeps track of all the case statements generated.
     Hashtable<AllocSite, StringBuilder> cases = new Hashtable<AllocSite, StringBuilder>();
     
     //Generate C cases 
     for (ConcreteRuntimeObjNode node : created.values()) {
-      if (!cases.containsKey(node.allocSite) && (          
-          //insetVariable case
-          (node.isInsetVar && (node.decendantsConflict() || node.hasPrimitiveConflicts())) ||
-          //non-inline-able code cases
-          (node.getNumOfReachableParents() != 1 && node.decendantsConflict()) ||
-          //Cases where resumes are possible
-          (node.hasPotentialToBeIncorrectDueToConflict) && node.decendantsObjConflict)) {
-
-        printDebug(javaDebug, node.allocSite + " qualified for case statement");
+      printDebug(javaDebug, "Considering " + node.allocSite + " for traversal");
+      if (!cases.containsKey(node.allocSite) && qualifiesForCaseStatement(node)) {
+        printDebug(javaDebug, "+\t" + node.allocSite + " qualified for case statement");
         addChecker(taint, node, cases, null, "ptr", 0);
       }
     }
-    //IMPORTANT: remember to change getTraverserInvocation if you change the line below
-    String methodName = "void traverse___" + removeInvalidChars(inVar) + 
-                        removeInvalidChars(rBlock) + "___(void * InVar)";
     
-    cFile.append(methodName + " {\n");
-    headerFile.append(methodName + ";\n");
+    String methodName;
+    int index=-1;
+
+    if (taint.isStallSiteTaint()) {
+      methodName= "void traverse___" + inVar + removeInvalidChars(rBlock) + "___(void * InVar, SESEstall *record)";
+    } else {
+      methodName= "void traverse___" + inVar + removeInvalidChars(rBlock) + "___(void * InVar, "+taint.getSESE().getSESErecordName() +" *record)";
+      FlatSESEEnterNode fsese=taint.getSESE();
+      TempDescriptor tmp=taint.getVar();
+      index=fsese.getInVarsForDynamicCoarseConflictResolution().indexOf(tmp);
+    }
+
+    cFile.println(methodName + " {");
+    headerFile.println(methodName + ";");
     
     if(cSideDebug) {
-      cFile.append("printf(\"The traverser ran for " + methodName + "\\n\");\n");
-    }
+      cFile.println("printf(\"The traverser ran for " + methodName + "\\n\");");
+      }
+
     
     if(cases.size() == 0) {
-      cFile.append(" return; }");
-    } 
-    else {
-      //clears queue and hashtable that keeps track of where we've been. 
-      cFile.append(clearQueue + "; " + resetVisitedHashTable + "; \n"); 
+      cFile.println(" return;");
+    } else {
+      cFile.println("    int totalcount=RUNBIAS;\n");
       
-      //Casts the ptr to a genericObjectStruct so we can get to the ptr->allocsite field. 
-      cFile.append("struct genericObjectStruct * ptr = (struct genericObjectStruct *) InVar;  if(InVar != NULL) { " + queryVistedHashtable
-          + "ptr); do { ");
+      if (taint.isStallSiteTaint()) {
+        cFile.println("    record->rcrRecords[0].count=RUNBIAS;\n");
+      } else {
+        cFile.println("    record->rcrRecords["+index+"].count=RUNBIAS;\n");
+        cFile.println("    record->rcrRecords["+index+"].index=0;\n");
+      }
       
-      cFile.append("switch(ptr->allocsite) { ");
+      //clears queue and hashtable that keeps track of where we've been. 
+      cFile.println(clearQueue + ";\n" + resetVisitedHashTable + ";"); 
+      //generic cast to ___Object___ to access ptr->allocsite field. 
+      cFile.println("struct ___Object___ * ptr = (struct ___Object___ *) InVar;\nif (InVar != NULL) {\n " + queryVistedHashtable + "(ptr);\n do {");
+      if (taint.isRBlockTaint()) {
+       cFile.println("  if(unlikely(record->common.doneExecuting)) {");
+       cFile.println("    record->common.rcrstatus=0;");
+       cFile.println("    return;");
+       cFile.println("  }");
+      }
+      cFile.println("  switch(ptr->allocsite) {");
       
-      for(AllocSite singleCase: cases.keySet())
+      for(AllocSite singleCase: cases.keySet()) {
         cFile.append(cases.get(singleCase));
+      }
+      
+      cFile.println("  default:\n    break; ");
+      cFile.println("  }\n } while((ptr = " + dequeueFromQueueInC + ") != NULL);\n}");
       
-      cFile.append(" default : break; ");
-      cFile.append("}} while( (ptr = " + dequeueFromQueueInC + ") != NULL); }}");
+      if (taint.isStallSiteTaint()) {
+        //need to add this
+        cFile.println("     if(atomic_sub_and_test(RUNBIAS-totalcount,&(record->rcrRecords[0].count))) {");
+        cFile.println("         psem_give_tag(record->common.parentsStallSem, record->tag);");
+        cFile.println("         BARRIER();");
+        cFile.println("         record->common.rcrstatus=0;");
+        cFile.println("}");
+      } else {
+        cFile.println("     if(atomic_sub_and_test(RUNBIAS-totalcount,&(record->rcrRecords["+index+"].count))) {");
+        cFile.println("        int flag=LOCKXCHG32(&(record->rcrRecords["+index+"].flag),0);");
+        cFile.println("        if(flag) {");
+        //we have resolved a heap root...see if this was the last dependence
+        cFile.println("            if(atomic_sub_and_test(1, &(record->common.unresolvedDependencies))) workScheduleSubmit((void *)record);");
+        cFile.println("        }");
+        cFile.println("     }");
+        cFile.println("     record->common.rcrstatus=0;");
+      }
     }
+    cFile.println("}");
     cFile.flush();
   }
   
   /*
-   * addChecker creates a case statement for every object that is either an inset variable
-   * or has multiple referencers (incoming edges). Else it just prints the checker for that object
-   * so that its processing can be pushed up to the referencer node. 
+   * addChecker creates a case statement for every object that is an inset variable, has more
+   * than 1 parent && has conflicts, or where resumes are possible (from waiting queue). 
+   * See .qualifiesForCaseStatement
    */
   private void addChecker(Taint taint, 
                           ConcreteRuntimeObjNode node, 
@@ -621,110 +717,158 @@ public class RuntimeConflictResolver {
                           String prefix, 
                           int depth) {
     StringBuilder currCase = possibleContinuingCase;
-    // We don't need a case statement for things with either 1 incoming or 0 out
-    // going edges, because they can be processed when checking the parent. 
-    if((node.isInsetVar && (node.decendantsConflict() || node.hasPrimitiveConflicts())) ||
-       (node.getNumOfReachableParents() != 1 && node.decendantsConflict()) || 
-        node.hasPotentialToBeIncorrectDueToConflict && node.decendantsObjConflict) {
+    if(qualifiesForCaseStatement(node)) {
       assert prefix.equals("ptr") && !cases.containsKey(node.allocSite);
       currCase = new StringBuilder();
       cases.put(node.allocSite, currCase);
-      currCase.append("case " + node.getAllocationSite() + ":\n { ");
+      currCase.append("  case " + node.getAllocationSite() + ": {\n");
     }
     //either currCase is continuing off a parent case or is its own. 
     assert currCase !=null;
     
-    //Casts C pointer; depth is used to create unique "myPtr" name for when things are inlined
-    String currPtr = "myPtr" + depth;
-    
-    String structType = node.original.getType().getSafeSymbol();
-    currCase.append(" struct " + structType + " * "+currPtr+"= (struct "+ structType + " * ) " + prefix + "; ");
-    
-    //Primitives Test
-    if(node.hasPrimitiveConflicts()) {
-      //This will check hashstructure, if cannot continue, add all to waiting queue and break; s
-      addCheckHashtableAndWaitingQ(currCase, taint, node, currPtr, depth);
-      currCase.append(" break; } ");
+    boolean primConfRead=false;
+    boolean primConfWrite=false;
+    boolean objConfRead=false;
+    boolean objConfWrite=false;
+
+    //Direct Primitives Test
+    for(String field: node.primitiveConflictingFields.keySet()) {
+      CombinedObjEffects effect=node.primitiveConflictingFields.get(field);
+      primConfRead|=effect.hasReadConflict;
+      primConfWrite|=effect.hasWriteConflict;
+    }
+
+    //Direct Object Reference Test
+    for(String field: node.objectRefs.keySet()) {
+      for(ObjRef ref: node.objectRefs.get(field)) {
+        CombinedObjEffects effect=ref.myEffects;
+        objConfRead|=effect.hasReadConflict;
+        objConfWrite|=effect.hasWriteConflict;
+      }
+    }
+
+    int index=-1;
+    if (taint.isRBlockTaint()) {
+      FlatSESEEnterNode fsese=taint.getSESE();
+      TempDescriptor tmp=taint.getVar();
+      index=fsese.getInVarsForDynamicCoarseConflictResolution().indexOf(tmp);
     }
-  
-    //Conflicts
-    for (ObjRef ref : node.objectRefs) {
-      // Will only process edge if there is some sort of conflict with the Child
-      if (ref.hasConflictsDownThisPath()) {
-        String childPtr = currPtr +"->___" + ref.field + "___";
 
-        // Checks if the child exists and has allocsite matching the conflict
-        currCase.append(" if(" + childPtr + " != NULL && " + childPtr + getAllocSiteInC + "=="
-            + ref.allocSite + ") { ");
+    String strrcr=taint.isRBlockTaint()?"&record->rcrRecords["+index+"], ":"NULL, ";
+    
+    //Do call if we need it.
+    if(primConfWrite||objConfWrite) {
+      int heaprootNum = connectedHRHash.get(taint).id;
+      assert heaprootNum != -1;
+      int allocSiteID = connectedHRHash.get(taint).getWaitingQueueBucketNum(node);
+      int traverserID = doneTaints.get(taint);
+        currCase.append("    int tmpkey"+depth+"=rcr_generateKey("+prefix+");\n");
+      if (objConfRead)
+        currCase.append("    int tmpvar"+depth+"=rcr_WTWRITEBINCASE(allHashStructures["+heaprootNum+"], tmpkey"+depth+", (SESEcommon *) record, "+strrcr+index+");\n");
+      else
+        currCase.append("    int tmpvar"+depth+"=rcr_WRITEBINCASE(allHashStructures["+heaprootNum+"], tmpkey"+depth+", (SESEcommon *) record, "+strrcr+index+");\n");
+    } else if (primConfRead||objConfRead) {
+      int heaprootNum = connectedHRHash.get(taint).id;
+      assert heaprootNum != -1;
+      int allocSiteID = connectedHRHash.get(taint).getWaitingQueueBucketNum(node);
+      int traverserID = doneTaints.get(taint);
+      currCase.append("    int tmpkey"+depth+"=rcr_generateKey("+prefix+");\n");
+      if (objConfRead) 
+        currCase.append("    int tmpvar"+depth+"=rcr_WTREADBINCASE(allHashStructures["+heaprootNum+"], tmpkey"+depth+", (SESEcommon *) record, "+strrcr+index+");\n");
+      else
+        currCase.append("    int tmpvar"+depth+"=rcr_READBINCASE(allHashStructures["+heaprootNum+"], tmpkey"+depth+", (SESEcommon *) record, "+strrcr+index+");\n");
+    }
 
+    if(primConfWrite||objConfWrite||primConfRead||objConfRead) {
+      currCase.append("if (!(tmpvar"+depth+"&READYMASK)) totalcount--;\n");
+    }
+    
+    //Handle conflicts further down. 
+    if(node.decendantsConflict()) {
+      int pdepth=depth+1;
+      currCase.append("{\n");
+      
+      //Array Case
+      if(node.isArray() && node.decendantsConflict()) {
+        String childPtr = "((struct ___Object___ **)(((char *) &(((struct ArrayObject *)"+ prefix+")->___length___))+sizeof(int)))[i]";
+        String currPtr = "arrayElement" + pdepth;
         
-        //Handles Direct Conflicts on child.
-        if(ref.hasDirectObjConflict()) { 
-        //This method will touch the waiting queues if necessary.
-          addCheckHashtableAndWaitingQ(currCase, taint, ref.child, childPtr, depth);
-          //Else if we can continue continue. 
-          currCase.append(" } else  { ");
-        }
+        currCase.append("{\n  int i;\n");
+        currCase.append("    struct ___Object___ * "+currPtr+";\n");
+        currCase.append("  for(i = 0; i<((struct ArrayObject *) " + prefix + " )->___length___; i++ ) {\n");
         
-        //If there are no direct conflicts (determined by static + dynamic), finish check
-        if (ref.child.decendantsConflict() || ref.child.hasPrimitiveConflicts()) {
-          // Checks if we have visited the child before
-          currCase.append(" if(" + queryVistedHashtable + childPtr + ")) { ");
-          if (ref.child.getNumOfReachableParents() == 1 && !ref.child.isInsetVar) {
-            addChecker(taint, ref.child, cases, currCase, childPtr, depth + 1);
-          }
-          else {
-            currCase.append(" " + addToQueueInC + childPtr + "); ");
-          }
+        //There should be only one field, hence we only take the first field in the keyset.
+        assert node.objectRefs.keySet().size() <= 1;
+        ObjRefList refsAtParticularField = node.objectRefs.get(node.objectRefs.keySet().iterator().next());
+        printObjRefSwitchStatement(taint,cases,pdepth,currCase,refsAtParticularField,childPtr,currPtr);
+        currCase.append("      }}\n");
+      } else {
+      //All other cases
+        String currPtr = "myPtr" + pdepth;
+        currCase.append("    struct ___Object___ * "+currPtr+";\n");
+        for(String field: node.objectRefs.keySet()) {
+          ObjRefList refsAtParticularField = node.objectRefs.get(field);
           
-          currCase.append(" } ");
-        }
-        //one more brace for the opening if
-        if(ref.hasDirectObjConflict()) {
-          currCase.append(" } ");
-        }
-        
-        currCase.append(" } ");
+          if(refsAtParticularField.hasConflicts()) {
+            String childPtr = "((struct "+node.original.getType().getSafeSymbol()+" *)"+prefix +")->___" + field + "___";
+            printObjRefSwitchStatement(taint, cases, depth, currCase, refsAtParticularField, childPtr, currPtr);
+          }
+        }      
       }
+      
+      currCase.append("}\n"); //For particular top level case statement. 
     }
-
-    if((node.isInsetVar && (node.decendantsConflict() || node.hasPrimitiveConflicts())) ||
-       (node.getNumOfReachableParents() != 1 && node.decendantsConflict()) || 
-       (node.hasPotentialToBeIncorrectDueToConflict && node.decendantsObjConflict)) {
-      currCase.append(" } break; \n");
+    if(qualifiesForCaseStatement(node)) {
+      currCase.append("  }\n  break;\n");
     }
   }
 
-  //This method will touch the waiting queues if necessary.
-  //IMPORTANT NOTE: This needs a closing } from the caller and the if is cannot continue
-  private void addCheckHashtableAndWaitingQ(StringBuilder currCase, Taint t, ConcreteRuntimeObjNode node, String ptr, int depth) {
-    Iterator<ConcreteRuntimeObjNode> it = node.enqueueToWaitingQueueUponConflict.iterator();
-    
-    currCase.append("int retval"+depth+" = "+ addCheckFromHashStructure + ptr + ");");
-    currCase.append("if(retval"+depth+" == " + conflictButTraverserCannotContinue + " || ");
-    checkWaitingQueue(currCase, t,  node);
-    currCase.append(") { \n");
-    //If cannot continue, then add all the undetermined references that lead from this child, including self.
-    //TODO need waitingQueue Side to automatically check the thing infront of it to prevent double adds. 
-    putIntoWaitingQueue(currCase, t, node, ptr);  
-    
-    ConcreteRuntimeObjNode related;
-    while(it.hasNext()) {
-      related = it.next();
-      //TODO maybe ptr won't even be needed since upon resume, the hashtable will remove obj. 
-      putIntoWaitingQueue(currCase, t, related, ptr);
+  private void printObjRefSwitchStatement(Taint taint, Hashtable<AllocSite, StringBuilder> cases,
+      int pDepth, StringBuilder currCase, ObjRefList refsAtParticularField, String childPtr,
+      String currPtr) {
+    
+    currCase.append("    "+currPtr+"= (struct ___Object___ * ) " + childPtr + ";\n");
+    currCase.append("    if (" + currPtr + " != NULL) { \n");
+    currCase.append("    switch(" + currPtr + getAllocSiteInC + ") {\n");
+    
+    for(ObjRef ref: refsAtParticularField) {
+      if(ref.child.decendantsConflict() || ref.child.hasPrimitiveConflicts()) {
+        currCase.append("      case "+ref.allocSite+":\n      {\n");
+        //The hash insert is here because we don't want to enqueue things unless we know it conflicts. 
+        currCase.append("        if (" + queryVistedHashtable +"("+ currPtr + ")) {\n");
+        
+        //Either it's an in-lineable case or we're just handling primitive conflicts
+        if ((ref.child.getNumOfReachableParents() == 1 && !ref.child.isInsetVar) ||
+            (ref.child.hasPrimitiveConflicts() && !qualifiesForCaseStatement(ref.child)))
+        {
+          addChecker(taint, ref.child, cases, currCase, currPtr, pDepth + 1);
+        }
+        else {
+          //if we are going to insert something into the queue, 
+          //we should be able to resume traverser from it. 
+          assert qualifiesForCaseStatement(ref.child);
+          currCase.append("        " + addToQueueInC + childPtr + ");\n ");
+        }
+        currCase.append("    }\n");  //close for queryVistedHashtable
+        
+        currCase.append("}\n"); //close for internal case statement
+      }
     }
-  }
-
-  /*
-  private void handleObjConflict(StringBuilder currCase, String childPtr, AllocSite allocSite, ObjRef ref) {
-    currCase.append("printf(\"Conflict detected with %p from parent with allocation site %u\\n\"," + childPtr + "," + allocSite.getUniqueAllocSiteID() + ");");
+    
+    currCase.append("    default:\n" +
+                           "       break;\n"+
+                           "    }}\n"); //internal switch. 
   }
   
-  private void handlePrimitiveConflict(StringBuilder currCase, String ptr, ArrayList<String> conflicts, AllocSite allocSite) {
-    currCase.append("printf(\"Primitive Conflict detected with %p with alloc site %u\\n\", "+ptr+", "+allocSite.getUniqueAllocSiteID()+"); ");
+  private boolean qualifiesForCaseStatement(ConcreteRuntimeObjNode node) {
+    return (          
+        //insetVariable case
+        (node.isInsetVar && (node.decendantsConflict() || node.hasPrimitiveConflicts())) ||
+        //non-inline-able code cases
+        (node.getNumOfReachableParents() != 1 && node.decendantsConflict()) ||
+        //Cases where resumes are possible
+        (node.hasPotentialToBeIncorrectDueToConflict) && node.decendantsObjConflict);
   }
-  */
   
   private Taint getProperTaintForFlatSESEEnterNode(FlatSESEEnterNode rblock, VariableNode var,
       Hashtable<Taint, Set<Effect>> effects) {
@@ -750,68 +894,13 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     }
     return null;
   }
-  
-  private void printEffectsAndConflictsSets(Taint taint, Set<Effect> localEffects,
-      Set<Effect> localConflicts) {
-    System.out.println("#### List of Effects/Conflicts ####");
-    System.out.println("For Taint " + taint);
-    System.out.println("Effects");
-    if(localEffects != null) {
-      for(Effect e: localEffects) {
-       System.out.println(e); 
-      }
-    }
-    System.out.println("Conflicts");
-    if(localConflicts != null) {
-      for(Effect e: localConflicts) {
-        System.out.println(e); 
-      }
-    }
-  }
 
   private void printDebug(boolean guard, String debugStatements) {
     if(guard)
       System.out.println(debugStatements);
   }
   
-  //TODO finish this once waitingQueue side is figured out
-  private void putIntoWaitingQueue(StringBuilder sb, Taint taint, ConcreteRuntimeObjNode node, String resumePtr ) {
-    //Method looks like this: void put(int allocSiteID,  x
-    //struct WaitingQueue * queue, //get this from hashtable
-    //int effectType, //not so sure we would actually need this one. 
-    //void * resumePtr, 
-    //int traverserID);  }
-    int heaprootNum = connectedHRHash.get(taint).id;
-    assert heaprootNum != -1;
-    int allocSiteID = connectedHRHash.get(taint).getWaitingQueueBucketNum(node);
-    int traverserID = doneTaints.get(taint);
-    
-    //NOTE if the C-side is changed, this will have to be changed accordingly
-    //TODO make sure this matches c-side
-    sb.append("put("+allocSiteID+", " +
-               "allHashStructures["+ heaprootNum +"]->waitingQueue, " +
-               resumePtr + ", " +
-               traverserID+");");
-  }
-  
-  //TODO finish waitingQueue side
-  /**
-   * Inserts check to see if waitingQueue is occupied.
-   * 
-   * On C-side, =0 means empty queue, else occupied. 
-   */
-  private void checkWaitingQueue(StringBuilder sb, Taint taint, ConcreteRuntimeObjNode node) {
-    //Method looks like int check(struct WaitingQueue * queue, int allocSiteID)
-    assert sb != null && taint !=null;    
-    int heaprootNum = connectedHRHash.get(taint).id;
-    assert heaprootNum != -1;
-    int allocSiteID = connectedHRHash.get(taint).getWaitingQueueBucketNum(node);
-    
-    sb.append(" (check(" + "allHashStructures["+ heaprootNum +"]->waitingQueue, " + allocSiteID + ") == "+ allocQueueIsNotEmpty+") ");
-  }
-  
   private void enumerateHeaproots() {
-    //reset numbers jsut in case
     weaklyConnectedHRCounter = 0;
     num2WeaklyConnectedHRGroup = new ArrayList<WeaklyConectedHRGroup>();
     
@@ -844,9 +933,9 @@ public class RuntimeConflictResolver {
         System.out.println("\t\t For Taint " + t);
         EffectsGroup eg = boe.taint2EffectsGroup.get(t);
           
-        if(eg.hasPrimativeConflicts()) {
+        if(eg.hasPrimitiveConflicts()) {
           System.out.print("\t\t\tPrimitive Conflicts at alloc " + as.getUniqueAllocSiteID() +" : ");
-          for(String field: eg.primativeConflictingFields) {
+          for(String field: eg.primitiveConflictingFields.keySet()) {
             System.out.print(field + " ");
           }
           System.out.println();
@@ -867,18 +956,22 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     
   }
   
-  private class EffectsGroup
-  {
+  private class EffectsGroup {
     Hashtable<String, CombinedObjEffects> myEffects;
-    ArrayList<String> primativeConflictingFields;
+    Hashtable<String, CombinedObjEffects> primitiveConflictingFields;
     
     public EffectsGroup() {
       myEffects = new Hashtable<String, CombinedObjEffects>();
-      primativeConflictingFields = new ArrayList<String>();
+      primitiveConflictingFields = new Hashtable<String, CombinedObjEffects>();
     }
 
-    public void addPrimative(Effect e) {
-      primativeConflictingFields.add(e.getField().toPrettyStringBrief());
+    public void addPrimitive(Effect e, boolean conflict) {
+      CombinedObjEffects effects;
+      if((effects = primitiveConflictingFields.get(e.getField().getSymbol())) == null) {
+        effects = new CombinedObjEffects();
+        primitiveConflictingFields.put(e.getField().getSymbol(), effects);
+      }
+      effects.add(e, conflict);
     }
     
     public void addObjEffect(Effect e, boolean conflict) {
@@ -891,13 +984,17 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     }
     
     public boolean isEmpty() {
-      return myEffects.isEmpty() && primativeConflictingFields.isEmpty();
+      return myEffects.isEmpty() && primitiveConflictingFields.isEmpty();
     }
     
-    public boolean hasPrimativeConflicts(){
-      return !primativeConflictingFields.isEmpty();
+    public boolean hasPrimitiveConflicts(){
+      return !primitiveConflictingFields.isEmpty();
     }
     
+    public CombinedObjEffects getPrimEffect(String field) {
+      return primitiveConflictingFields.get(field);
+    }
+
     public boolean hasObjectEffects() {
       return !myEffects.isEmpty();
     }
@@ -960,6 +1057,22 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     public boolean hasConflict() {
       return hasReadConflict || hasWriteConflict || hasStrongUpdateConflict;
     }
+
+    public void mergeWith(CombinedObjEffects other) {
+      for(Effect e: other.originalEffects) {
+        if(!originalEffects.contains(e)){
+          originalEffects.add(e);
+        }
+      }
+      
+      hasReadEffect |= other.hasReadEffect;
+      hasWriteEffect |= other.hasWriteEffect;
+      hasStrongUpdateEffect |= other.hasStrongUpdateEffect;
+      
+      hasReadConflict |= other.hasReadConflict;
+      hasWriteConflict |= other.hasWriteConflict;
+      hasStrongUpdateConflict |= other.hasStrongUpdateConflict;
+    }
   }
 
   //This will keep track of a reference
@@ -989,11 +1102,31 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     public boolean hasDirectObjConflict() {
       return myEffects.hasConflict();
     }
+    
+    public boolean equals(Object other) {
+      if(other == null || !(other instanceof ObjRef)) 
+        return false;
+      
+      ObjRef o = (ObjRef) other;
+      
+      if(o.field == this.field && o.allocSite == this.allocSite && this.child.equals(o.child))
+        return true;
+      
+      return false;
+    }
+    
+    public int hashCode() {
+      return child.allocSite.hashCode() ^ field.hashCode();
+    }
+
+    public void mergeWith(ObjRef ref) {
+      myEffects.mergeWith(ref.myEffects);
+    }
   }
 
   private class ConcreteRuntimeObjNode {
-    ArrayList<ObjRef> objectRefs;
-    ArrayList<String> conflictingPrimitiveFields;
+    Hashtable<String, ObjRefList> objectRefs;
+    Hashtable<String, CombinedObjEffects> primitiveConflictingFields;
     HashSet<ConcreteRuntimeObjNode> parentsWithReadToNode;
     HashSet<ConcreteRuntimeObjNode> parentsThatWillLeadToConflicts;
     //this set keeps track of references down the line that need to be enqueued if traverser is "paused"
@@ -1006,8 +1139,8 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     HeapRegionNode original;
 
     public ConcreteRuntimeObjNode(HeapRegionNode me, boolean isInVar) {
-      objectRefs = new ArrayList<ObjRef>();
-      conflictingPrimitiveFields = null;
+      objectRefs = new Hashtable<String, ObjRefList>(5);
+      primitiveConflictingFields = null;
       parentsThatWillLeadToConflicts = new HashSet<ConcreteRuntimeObjNode>();
       parentsWithReadToNode = new HashSet<ConcreteRuntimeObjNode>();
       enqueueToWaitingQueueUponConflict = new HashSet<ConcreteRuntimeObjNode>();
@@ -1024,8 +1157,11 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     }
 
     @Override
-    public boolean equals(Object obj) {
-      return original.equals(obj);
+    public boolean equals(Object other) {
+      if(other == null || !(other instanceof ConcreteRuntimeObjNode)) 
+        return false;
+      
+      return original.equals(((ConcreteRuntimeObjNode)other).original);
     }
 
     public int getAllocationSite() {
@@ -1037,7 +1173,7 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     }
     
     public boolean hasPrimitiveConflicts() {
-      return conflictingPrimitiveFields != null;
+      return primitiveConflictingFields != null && !primitiveConflictingFields.isEmpty();
     }
     
     public boolean decendantsConflict() {
@@ -1066,18 +1202,80 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     }
 
     public void addObjChild(String field, ConcreteRuntimeObjNode child, CombinedObjEffects ce) {
+      printDebug(javaDebug,this.allocSite.getUniqueAllocSiteID() + " added child at " + child.getAllocationSite());
       ObjRef ref = new ObjRef(field, child, ce);
-      objectRefs.add(ref);
+      
+      if(objectRefs.containsKey(field)){
+        ObjRefList array = objectRefs.get(field);
+        
+        if(array.contains(ref)) {
+          ObjRef other = array.get(array.indexOf(ref));
+          other.mergeWith(ref);
+          printDebug(javaDebug,"    Merged with old");
+          printDebug(javaDebug,"    Old="+ other.child.original + "\n    new="+ref.child.original);
+        }
+        else {
+          array.add(ref);
+          printDebug(javaDebug,"    Just added new;\n      Field: " + field);
+          printDebug(javaDebug,"      AllocSite: " + child.getAllocationSite());
+          printDebug(javaDebug,"      Child: "+child.original);
+        }
+      }
+      else {
+        ObjRefList array = new ObjRefList(3);
+        
+        array.add(ref);
+        objectRefs.put(field, array);
+      }
     }
     
-    public String toString()
-    {
+    public boolean isArray() {
+      return original.getType().isArray();
+    }
+    
+    public ArrayList<Integer> getReferencedAllocSites() {
+      ArrayList<Integer> list = new ArrayList<Integer>();
+      
+      for(String key: objectRefs.keySet()) {
+        for(ObjRef r: objectRefs.get(key)) {
+          if(r.hasDirectObjConflict() || (r.child.parentsWithReadToNode.contains(this) && r.hasConflictsDownThisPath())) {
+            list.add(r.allocSite);
+          }
+        }
+      }
+      
+      return list;
+    }
+    
+    public String toString() {
       return "AllocSite=" + getAllocationSite() + " myConflict=" + !parentsThatWillLeadToConflicts.isEmpty() + 
               " decCon="+decendantsObjConflict+ 
               " NumOfConParents=" + getNumOfReachableParents() + " ObjectChildren=" + objectRefs.size();
     }
   }
   
+  //Simple extension of the ArrayList to allow it to find if any ObjRefs conflict.
+  private class ObjRefList extends ArrayList<ObjRef> {
+    private static final long serialVersionUID = 326523675530835596L;
+    
+    public ObjRefList(int size) {
+      super(size);
+    }
+    
+    public boolean add(ObjRef o){
+      return super.add(o);
+    }
+    
+    public boolean hasConflicts() {
+      for(ObjRef r: this) {
+        if(r.hasConflictsDownThisPath() || r.child.hasPrimitiveConflicts())
+          return true;
+      }
+      
+      return false;
+    }
+  }
+  
   private class EffectsTable {
     private Hashtable<AllocSite, BucketOfEffects> table;
 
@@ -1088,15 +1286,14 @@ public class RuntimeConflictResolver {
       // rehash all effects (as a 5-tuple) by their affected allocation site
       for (Taint t : effects.keySet()) {
         Set<Effect> localConflicts = conflicts.get(t);
-
         for (Effect e : effects.get(t)) {
           BucketOfEffects bucket;
           if ((bucket = table.get(e.getAffectedAllocSite())) == null) {
             bucket = new BucketOfEffects();
             table.put(e.getAffectedAllocSite(), bucket);
           }
-          printDebug(javaDebug, "Added Taint" + t + " Effect " + e + "Conflict Status = " + localConflicts.contains(e));
-          bucket.add(t, e, localConflicts.contains(e));
+          printDebug(javaDebug, "Added Taint" + t + " Effect " + e + "Conflict Status = " + (localConflicts!=null?localConflicts.contains(e):false)+" localConflicts = "+localConflicts);
+          bucket.add(t, e, localConflicts!=null?localConflicts.contains(e):false);
         }
       }
     }
@@ -1104,17 +1301,21 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     public EffectsGroup getEffects(AllocSite parentKey, Taint taint) {
       //This would get the proper bucket of effects and then get all the effects
       //for a parent for a specific taint
-      return table.get(parentKey).taint2EffectsGroup.get(taint);
+      try {
+        return table.get(parentKey).taint2EffectsGroup.get(taint);
+      }
+      catch (NullPointerException e) {
+        return null;
+      }
     }
 
     // Run Analysis will walk the data structure and figure out the weakly
     // connected heap roots. 
-    public void runAnaylsis() {
+    public void runAnalysis() {
       if(javaDebug) {
         printoutTable(this); 
       }
       
-      //TODO is there a higher performance way to do this? 
       for(AllocSite key: table.keySet()) {
         BucketOfEffects effects = table.get(key);
         //make sure there are actually conflicts in the bucket
@@ -1154,8 +1355,7 @@ public class RuntimeConflictResolver {
     public int getWaitingQueueBucketNum(ConcreteRuntimeObjNode node) {
       if(allocSiteToWaitingQueueMap.containsKey(node.allocSite)) {
         return allocSiteToWaitingQueueMap.get(node.allocSite);
-      }
-      else {
+      } else {
         allocSiteToWaitingQueueMap.put(node.allocSite, waitingQueueCounter);
         return waitingQueueCounter++;
       }
@@ -1204,9 +1404,9 @@ public class RuntimeConflictResolver {
         taint2EffectsGroup.put(t, effectsForGivenTaint);
       }
 
-      if (e.getField().getType().isPrimitive()) {
+      if (isReallyAPrimitive(e.getField().getType())) {
         if (conflict) {
-          effectsForGivenTaint.addPrimative(e);
+          effectsForGivenTaint.addPrimitive(e, true);
         }
       } else {
         effectsForGivenTaint.addObjEffect(e, conflict);
@@ -1232,9 +1432,9 @@ public class RuntimeConflictResolver {
   
   private class TaintAndInternalHeapStructure {
     public Taint t;
-    public Hashtable<AllocSite, ConcreteRuntimeObjNode> nodesInHeap;
+    public Hashtable<Integer, ConcreteRuntimeObjNode> nodesInHeap;
     
-    public TaintAndInternalHeapStructure(Taint taint, Hashtable<AllocSite, ConcreteRuntimeObjNode> nodesInHeap) {
+    public TaintAndInternalHeapStructure(Taint taint, Hashtable<Integer, ConcreteRuntimeObjNode> nodesInHeap) {
       t = taint;
       this.nodesInHeap = nodesInHeap;
     }